More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3204 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3409  Aldehyde Dehydrogenase  72.51 
 
 
514 aa  771    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.233774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3204  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
515 aa  1060    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2932  aldehyde dehydrogenase  89.51 
 
 
515 aa  941    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5513  aldehyde dehydrogenase  58.43 
 
 
547 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1038  aldehyde dehydrogenase  56.58 
 
 
530 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1567  aldehyde dehydrogenase  57.75 
 
 
523 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1516  aldehyde dehydrogenase  58.8 
 
 
523 aa  551  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2708  aldehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  27.1 
 
 
475 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  25.11 
 
 
455 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1944  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.03 
 
 
479 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  25.56 
 
 
454 aa  147  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  26.57 
 
 
480 aa  143  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  27.02 
 
 
484 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.93 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  27.2 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.02 
 
 
498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  27.94 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  25.55 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  27.39 
 
 
465 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  26.96 
 
 
465 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  25.59 
 
 
485 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  24.14 
 
 
484 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  25.53 
 
 
480 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  26.07 
 
 
477 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  26.29 
 
 
477 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  26.21 
 
 
482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  26.52 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.51 
 
 
483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2417  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.25 
 
 
525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.02914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  24.44 
 
 
500 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  24.68 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  25.57 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  24.95 
 
 
466 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  25.48 
 
 
496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  28.42 
 
 
498 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
482 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2692  succinate semialdehyde dehydrogenase  25.05 
 
 
491 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.41255  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  26.55 
 
 
495 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  26.55 
 
 
485 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  23.3 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.05 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2634  Aldehyde Dehydrogenase  25.99 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  26.76 
 
 
477 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  25.56 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4623  aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.93 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  25.11 
 
 
477 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  25.59 
 
 
481 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  25.77 
 
 
476 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0677  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
478 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663172  normal  0.354632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1095  Aldehyde Dehydrogenase  27.51 
 
 
479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1869  Aldehyde Dehydrogenase  25.38 
 
 
488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  25.57 
 
 
477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3471  aldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.793386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2614  aldehyde dehydrogenase  28.7 
 
 
478 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.45 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  25.89 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  24.52 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2161  Aldehyde Dehydrogenase  27.78 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.046835  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  24.9 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  25.27 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  25.68 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  26.95 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2725  succinate semialdehyde dehydrogenase  24.78 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.774266  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  25 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  25 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  26.01 
 
 
462 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  25.26 
 
 
493 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  24.68 
 
 
485 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5232  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  25.27 
 
 
498 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88595  normal  0.882474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  26.96 
 
 
499 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  25.9 
 
 
482 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  26.01 
 
 
462 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  24.79 
 
 
482 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  24.58 
 
 
491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  24.52 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.94 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  25.94 
 
 
482 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  26.01 
 
 
462 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2566  Aldehyde Dehydrogenase  27.78 
 
 
478 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  24.22 
 
 
477 aa  127  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  26.99 
 
 
485 aa  127  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  25.94 
 
 
482 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.94 
 
 
482 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  23.76 
 
 
483 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  26.61 
 
 
533 aa  127  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  24.75 
 
 
478 aa  127  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  25.85 
 
 
491 aa  127  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  26.92 
 
 
480 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.04 
 
 
483 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  24.04 
 
 
483 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  24.9 
 
 
482 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1153  Aldehyde Dehydrogenase  25.23 
 
 
474 aa  126  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.720982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.04 
 
 
483 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  24.63 
 
 
471 aa  125  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  26.27 
 
 
489 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>