More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2932 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3409  Aldehyde Dehydrogenase  72.21 
 
 
514 aa  760    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.233774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3204  aldehyde dehydrogenase  89.51 
 
 
515 aa  959    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2932  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
515 aa  1061    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5513  aldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 
547 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1038  aldehyde dehydrogenase  57.37 
 
 
530 aa  569  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1567  aldehyde dehydrogenase  57.75 
 
 
523 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1516  aldehyde dehydrogenase  59.01 
 
 
523 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2708  aldehyde dehydrogenase  50.7 
 
 
503 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  25.56 
 
 
455 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  27.21 
 
 
475 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.91 
 
 
498 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  26.79 
 
 
480 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  27.85 
 
 
484 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2417  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.67 
 
 
525 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.02914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  27.45 
 
 
465 aa  144  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1944  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.48 
 
 
479 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  28.45 
 
 
480 aa  144  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  26.4 
 
 
474 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  27.23 
 
 
465 aa  143  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  26.97 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  26.4 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  26.4 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  24.95 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  26.26 
 
 
480 aa  141  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0496  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.31 
 
 
486 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.9 
 
 
483 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  26.4 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  25.79 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  24.89 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  26.4 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.29 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  26.87 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  26.4 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  26.71 
 
 
496 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
495 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  25.56 
 
 
500 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
477 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
485 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.57 
 
 
482 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.57 
 
 
482 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.57 
 
 
482 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.57 
 
 
482 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  26.02 
 
 
477 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.99 
 
 
480 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  25.78 
 
 
474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.36 
 
 
482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.36 
 
 
482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  26.57 
 
 
482 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.36 
 
 
482 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  26.57 
 
 
482 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  25.32 
 
 
466 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.57 
 
 
482 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.57 
 
 
482 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  24.22 
 
 
454 aa  137  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.45 
 
 
480 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  26.36 
 
 
482 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.62 
 
 
480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  27.64 
 
 
485 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
482 aa  137  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  26.29 
 
 
474 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3471  aldehyde dehydrogenase  26.23 
 
 
498 aa  136  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.793386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  27.64 
 
 
485 aa  136  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.23 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.21 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1783  aldehyde dehydrogenase  28.29 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  26.02 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2725  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.19 
 
 
515 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.774266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2692  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
491 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.41255  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.49 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.49 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  24.49 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.12 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  23.75 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.49 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.43 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  26.24 
 
 
477 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.23 
 
 
480 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  25.88 
 
 
474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  24.26 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.49 
 
 
483 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  27.16 
 
 
476 aa  134  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  25.27 
 
 
496 aa  134  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  25 
 
 
477 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5232  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
498 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88595  normal  0.882474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.53 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  26.13 
 
 
480 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  25.11 
 
 
485 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  24.26 
 
 
482 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  26.83 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2634  Aldehyde Dehydrogenase  25.45 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.21 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1153  Aldehyde Dehydrogenase  26.13 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.720982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.26 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.23 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1262  Aldehyde Dehydrogenase  27.23 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1546  succinate-semialdehyde dehydrogenase, putative  27.23 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  24.21 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  26.97 
 
 
479 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
483 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.85 
 
 
993 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>