More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2708 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2708  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
503 aa  1008    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3204  aldehyde dehydrogenase  51.1 
 
 
515 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2932  aldehyde dehydrogenase  50.7 
 
 
515 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3409  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
514 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.233774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1038  aldehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
530 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5513  aldehyde dehydrogenase  49.4 
 
 
547 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1516  aldehyde dehydrogenase  52.8 
 
 
523 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1567  aldehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
523 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
482 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  29.1 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  28.85 
 
 
465 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  28.79 
 
 
481 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  28.31 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.24 
 
 
488 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  27.9 
 
 
480 aa  146  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
488 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.31 
 
 
488 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  28.95 
 
 
480 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  28.95 
 
 
480 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.17 
 
 
480 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  24.78 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.99 
 
 
477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  24.33 
 
 
482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  28.16 
 
 
485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  27.31 
 
 
496 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  27.96 
 
 
488 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  24.78 
 
 
457 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2417  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.54 
 
 
525 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.02914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  29.04 
 
 
488 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  27.08 
 
 
485 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  26.96 
 
 
484 aa  137  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.96 
 
 
482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  26.49 
 
 
476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  25.98 
 
 
479 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.96 
 
 
482 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.43 
 
 
475 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  26.94 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  25.98 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  26.21 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  29.15 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  27.35 
 
 
488 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.98 
 
 
479 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
479 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2507  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  27.11 
 
 
503 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
480 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
480 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  26.68 
 
 
483 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  25.82 
 
 
454 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  27.42 
 
 
484 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  24.89 
 
 
488 aa  134  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  25.66 
 
 
490 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.73 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.73 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  25.27 
 
 
479 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
495 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  24.89 
 
 
488 aa  133  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
485 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
507 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  28.74 
 
 
481 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  25.48 
 
 
477 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  25.97 
 
 
502 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  26.6 
 
 
499 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  25 
 
 
464 aa  133  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  26.57 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  25.28 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.28 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.28 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.51 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  25.28 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.94 
 
 
500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  26.58 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  29.93 
 
 
475 aa  131  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 
501 aa  131  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  27.36 
 
 
480 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.28 
 
 
482 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  30.98 
 
 
482 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  26.52 
 
 
485 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  23.94 
 
 
484 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  25.27 
 
 
478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  24.74 
 
 
480 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3876  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.61 
 
 
489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  0.0425883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  28.81 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  22.7 
 
 
477 aa  130  6e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  25.06 
 
 
482 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  27.53 
 
 
479 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3401  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 
479 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  25.28 
 
 
482 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  26.46 
 
 
485 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3952  Aldehyde Dehydrogenase  28.6 
 
 
488 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73153  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  22.92 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  26.57 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>