More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0781 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  93.82 
 
 
241 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  82.54 
 
 
203 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  78.52 
 
 
146 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  84.92 
 
 
205 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  84.92 
 
 
213 aa  222  5e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  75.71 
 
 
146 aa  221  1e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  81.6 
 
 
148 aa  214  1e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  78.91 
 
 
152 aa  212  5e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  82.2 
 
 
147 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  82.2 
 
 
147 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  82.2 
 
 
147 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  81.36 
 
 
149 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  71.32 
 
 
129 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  81.74 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  81.74 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  81.74 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  81.74 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  81.74 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  81.74 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  81.74 
 
 
154 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  80.87 
 
 
154 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  69.23 
 
 
130 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  70.15 
 
 
250 aa  201  1e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  78.95 
 
 
154 aa  201  1e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  78.07 
 
 
151 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  62.86 
 
 
289 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  66.91 
 
 
261 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  65.44 
 
 
274 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  61.04 
 
 
221 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  67.74 
 
 
189 aa  183  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  64.84 
 
 
274 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  64.84 
 
 
262 aa  179  3e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  63.93 
 
 
233 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  66.38 
 
 
261 aa  172  3e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  65.08 
 
 
263 aa  172  4e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  55.56 
 
 
121 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  56.48 
 
 
115 aa  134  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  56.19 
 
 
117 aa  134  2e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  52 
 
 
158 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  45.97 
 
 
119 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  50 
 
 
115 aa  105  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  48.08 
 
 
114 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  41.67 
 
 
109 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  8.80611e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  40.74 
 
 
109 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.76434e-08  unclonable  3.77675e-11 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  45.19 
 
 
118 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  45.19 
 
 
118 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  42 
 
 
164 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.93 
 
 
122 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  41.67 
 
 
123 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  38.61 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  44.44 
 
 
116 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  5.27491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  42.59 
 
 
128 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  38.6 
 
 
115 aa  93.6  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.5875e-09  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  43.14 
 
 
166 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  41.67 
 
 
109 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  7.43073e-09  decreased coverage  2.04323e-07 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  44.23 
 
 
130 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  39.25 
 
 
148 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  38.6 
 
 
124 aa  92.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  40.59 
 
 
135 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  39.39 
 
 
112 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  43.64 
 
 
123 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  39.81 
 
 
143 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  39.36 
 
 
128 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.89424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  40.91 
 
 
156 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  44.09 
 
 
131 aa  89.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  39.39 
 
 
112 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  38.61 
 
 
150 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  43.96 
 
 
106 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  43.96 
 
 
106 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  40.78 
 
 
114 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.32969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  40.4 
 
 
112 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  40.78 
 
 
114 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.16802e-08  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  44.23 
 
 
117 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  40.78 
 
 
109 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.43508e-10  hitchhiker  4.78913e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  40.78 
 
 
109 aa  88.6  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  39 
 
 
108 aa  88.6  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  43.01 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  41.49 
 
 
159 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  41.05 
 
 
137 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  38.68 
 
 
135 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  36.84 
 
 
115 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.23789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  40.78 
 
 
109 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  8.6194e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  41.76 
 
 
147 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  45.05 
 
 
158 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  41.76 
 
 
149 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  43.01 
 
 
156 aa  86.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  37.86 
 
 
120 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  45.05 
 
 
139 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  45.05 
 
 
139 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  41 
 
 
140 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  38.46 
 
 
105 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.04193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  37.86 
 
 
123 aa  85.9  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  37.86 
 
 
109 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  37.5 
 
 
108 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.97602e-10  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  37.86 
 
 
114 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  9.71305e-10  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  44 
 
 
146 aa  85.5  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  38.89 
 
 
120 aa  85.5  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  37.86 
 
 
114 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.84153e-09  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  37.86 
 
 
114 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.29081e-07  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>