More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0614 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  92.25 
 
 
130 aa  246  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  71.32 
 
 
256 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  70.45 
 
 
241 aa  200  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  66.15 
 
 
146 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  67.18 
 
 
146 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  66.67 
 
 
203 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  69.49 
 
 
149 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  68.64 
 
 
148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  68.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  68.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  68.64 
 
 
147 aa  180  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  65.87 
 
 
205 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  65.87 
 
 
213 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  65.35 
 
 
152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  62.04 
 
 
154 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  68.7 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  67.54 
 
 
154 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  68.42 
 
 
151 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  60.77 
 
 
250 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  59.68 
 
 
189 aa  157  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  58.87 
 
 
221 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  57.6 
 
 
261 aa  153  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  56.1 
 
 
274 aa  152  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  55.47 
 
 
262 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  55.47 
 
 
274 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  54.47 
 
 
289 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  54.92 
 
 
233 aa  150  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  57.76 
 
 
261 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  56.91 
 
 
263 aa  149  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  57.02 
 
 
121 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  52.78 
 
 
115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  48.7 
 
 
117 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  48.57 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  50 
 
 
114 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  42.74 
 
 
119 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  43.81 
 
 
115 aa  100  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  45.13 
 
 
118 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  44.25 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.36 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  37.96 
 
 
109 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  43.36 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  47 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  47 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  38.89 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  47 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  39.81 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  43 
 
 
108 aa  91.7  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  37.37 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  41.12 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  40.5 
 
 
140 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  37.38 
 
 
109 aa  90.1  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  36.28 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  36.54 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  40 
 
 
105 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  35.19 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  35.51 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  35.51 
 
 
109 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  36.19 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  43.96 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  35.24 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  37.84 
 
 
148 aa  87.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  38 
 
 
164 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  39.42 
 
 
105 aa  86.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  35.51 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  38.46 
 
 
400 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  39.36 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.3 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  35.19 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  39.64 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  37.25 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  37.86 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  38.78 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  38.32 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  41.75 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  42 
 
 
173 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  38.95 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  39.47 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  38.95 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  39.05 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  40.78 
 
 
109 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  37.04 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  34.62 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  41.12 
 
 
164 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  36.7 
 
 
109 aa  84  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  39.22 
 
 
118 aa  83.6  8e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  40.95 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  35.24 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>