More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07936 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  73.98 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  66.94 
 
 		 123 aa  173  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  50.42 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  48.7 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  44.44 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  41.74 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  39.5 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  38.33 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  36.92 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  38.52 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  41.38 
 
 		 261 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  40.38 
 
 		 289 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  38.02 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  38.46 
 
 		 221 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  38.26 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  38.26 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  38.26 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  41.12 
 
 		 274 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  38.46 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0467  iojap-like protein  45.87 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.979719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  40 
 
 		 274 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  40 
 
 		 262 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  44.68 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  41.23 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  39.81 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  46.46 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  41.35 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  43.64 
 
 		 256 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  39.13 
 
 		 261 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  37.39 
 
 		 263 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  43.64 
 
 		 241 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  40.68 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  41.58 
 
 		 114 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  38.53 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  41.41 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  44.09 
 
 		 158 aa  87  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  36.84 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  37.38 
 
 		 233 aa  87  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  41.51 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  35.29 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  41.84 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  37.17 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  41.84 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  39.29 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  38.46 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  36.52 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  36.52 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  39.25 
 
 		 250 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  36.28 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  37.27 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  36.11 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  37.27 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  37.04 
 
 		 109 aa  83.6  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  39.64 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  34.78 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  39.82 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  40 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  39.25 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  36.36 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  38.39 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  38.18 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  35.19 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  35.45 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  35.45 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  38.32 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  35.45 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  38.38 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  38.38 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  36.36 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  34.78 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  40 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  39.82 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  37.61 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  37.61 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  35.45 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  33.06 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  38 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  39.32 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  36.36 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  42.11 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  39.45 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  39.82 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  39.25 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  40 
 
 		 205 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  36.52 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  35.71 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  38.05 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  41.24 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  37.17 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  40 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  38.32 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  40.21 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  37.38 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  37.37 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  37.38 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  37.63 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  36.36 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  36.45 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>