More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2933 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  100 
 
 		 115 aa  233  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  85.05 
 
 		 109 aa  196  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  80.73 
 
 		 109 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  77.48 
 
 		 114 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  77.48 
 
 		 114 aa  184  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  77.48 
 
 		 114 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  78.7 
 
 		 109 aa  184  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  79.63 
 
 		 114 aa  182  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  79.63 
 
 		 114 aa  182  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  77.06 
 
 		 109 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  76.15 
 
 		 109 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  78.5 
 
 		 109 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  78.5 
 
 		 109 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  76.15 
 
 		 109 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  74.31 
 
 		 108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  64.15 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  63.81 
 
 		 105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  61.39 
 
 		 105 aa  133  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  56.6 
 
 		 108 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  55.45 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  55.24 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  55.24 
 
 		 105 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  51.43 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  53.47 
 
 		 105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  48.11 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  123  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  53.33 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  49.07 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  50.46 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  53.85 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  52.88 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  50.96 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  50.96 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  51.38 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  57.45 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  55.88 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  56.38 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  47.62 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  44.76 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  41.75 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  49.5 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  47.06 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  45.71 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  49.53 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  45.71 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  45.71 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  46.08 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  46.73 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  46.08 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  43.56 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  43.27 
 
 		 203 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  47.57 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  41.9 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  41.18 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  44.23 
 
 		 205 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  44.23 
 
 		 213 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  41.75 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  43.69 
 
 		 168 aa  96.7  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  42.31 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  42.31 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  43.43 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  50.96 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  46.94 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  42.31 
 
 		 241 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  43.88 
 
 		 166 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  42.06 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  42.57 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  38.6 
 
 		 256 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  41.35 
 
 		 149 aa  93.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  43.56 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  44.12 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  50.5 
 
 		 173 aa  94  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  41.35 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  41.35 
 
 		 154 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  41 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  41.35 
 
 		 154 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.53 
 
 		 135 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  41.35 
 
 		 154 aa  93.2  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  41.35 
 
 		 154 aa  93.2  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  41.35 
 
 		 147 aa  93.2  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>