More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3201 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  100 
 
 
131 aa  263  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  76.56 
 
 
131 aa  207  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  73.23 
 
 
128 aa  194  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  64.29 
 
 
128 aa  174  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  64.29 
 
 
128 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  62.71 
 
 
135 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  52.54 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  54.55 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  50.43 
 
 
150 aa  116  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.86 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  51.61 
 
 
117 aa  103  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  43.22 
 
 
118 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  50.53 
 
 
114 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  48.98 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  47.52 
 
 
107 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  42.11 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  46.08 
 
 
191 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  47.31 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  39.64 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  39.64 
 
 
112 aa  93.6  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  48.94 
 
 
198 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  48.94 
 
 
198 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  47.37 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  42.86 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  46.74 
 
 
118 aa  92  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  49.44 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  41.51 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  40.52 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.83 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  46 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  41.94 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  43.14 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  38.98 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  41.12 
 
 
119 aa  90.9  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  48.31 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  48.48 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  46.07 
 
 
156 aa  90.1  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0838  Iojap-related protein  44.21 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  45.74 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  47.19 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  44.33 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  46.67 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  36.97 
 
 
226 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  46.07 
 
 
117 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  40.57 
 
 
144 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  42.99 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  43.81 
 
 
129 aa  88.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  47.37 
 
 
158 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  42.99 
 
 
137 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  42.06 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  44.76 
 
 
150 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08901  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  39.45 
 
 
124 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116014 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.34 
 
 
124 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  44.21 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  42.06 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  44.09 
 
 
256 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  47.19 
 
 
128 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  43.93 
 
 
166 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  40 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  48.35 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  48.31 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  38.89 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  44.09 
 
 
241 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  44.21 
 
 
118 aa  87.8  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  46.24 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  41.75 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  39.64 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  37.93 
 
 
124 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  38.21 
 
 
152 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  52 
 
 
132 aa  87  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  39.62 
 
 
144 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  44.32 
 
 
105 aa  87  9e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  47.96 
 
 
115 aa  87  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  38.32 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  43.01 
 
 
203 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  43.33 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  41.12 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  37.38 
 
 
116 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  41.73 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  42.73 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  41.9 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  39.82 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  40.86 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  43.69 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  40.86 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  43.01 
 
 
210 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  46.08 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  45.63 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  41.75 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  44.44 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  46.81 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  43.01 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  43.18 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  40 
 
 
213 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  39.78 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  37.38 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  40 
 
 
205 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  40 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  38.74 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  41.28 
 
 
114 aa  84  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>