More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3209 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  76.56 
 
 
131 aa  207  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  70.08 
 
 
128 aa  187  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  67.46 
 
 
128 aa  178  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  67.46 
 
 
128 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  63.25 
 
 
135 aa  157  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  58.12 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  48.62 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  47.01 
 
 
118 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  46.55 
 
 
150 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  48.6 
 
 
107 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  46.32 
 
 
114 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  50 
 
 
198 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  50 
 
 
198 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  46.23 
 
 
191 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  46.39 
 
 
117 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  41.96 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  43.88 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  45.13 
 
 
120 aa  92.8  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1761  iojap-like protein  41.07 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40.19 
 
 
114 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  39.13 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  43.12 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  39.22 
 
 
226 aa  89.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  43.27 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  43.14 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  45.05 
 
 
118 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  39.81 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  38.32 
 
 
116 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  41.18 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  40.74 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  43.3 
 
 
120 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0933  iojap-like protein  51.69 
 
 
102 aa  87.4  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  38.68 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  43.96 
 
 
129 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  40.4 
 
 
166 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  42 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  45.63 
 
 
115 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0798  iojap-like protein  36.36 
 
 
120 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.411993  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  40.22 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  38.3 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  39.62 
 
 
131 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  44.94 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  40 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0838  Iojap-related protein  43.96 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  40.38 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  39.13 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1149  iojap-like protein  46.94 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  36.45 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  40.43 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  43.12 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  34.26 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  44.79 
 
 
118 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  42.86 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  42 
 
 
168 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  42.22 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08901  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  39.56 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116014 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  42.16 
 
 
166 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  42.7 
 
 
128 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  39.42 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  41.88 
 
 
124 aa  84  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  42.02 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.98 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  46.67 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  41.57 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  39.78 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1140  iojap-like protein  38.78 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000105704  normal  0.940401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  39.25 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  41.57 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  39 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  36.52 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  41.57 
 
 
117 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  38.46 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  34.86 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  39.81 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  34.83 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  40.86 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  38.32 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  41.76 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  39.39 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  38.24 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  36.73 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  40.91 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  41.88 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  39.77 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  38.24 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  36.28 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  39.22 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  35.14 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  35 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  39.33 
 
 
256 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  35.71 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  40.4 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  42.55 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  38.24 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  36.96 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  39.78 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  41.76 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  39.78 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>