More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3248 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  94.23 
 
 
104 aa  205  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  59.13 
 
 
116 aa  149  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2299  iojap-like protein  58.24 
 
 
91 aa  120  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000554928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  47.83 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  46.96 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  46.96 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  46.96 
 
 
122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  42.73 
 
 
120 aa  100  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  45.87 
 
 
158 aa  100  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  47.57 
 
 
118 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  46.23 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  44.35 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  48.08 
 
 
117 aa  97.8  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  42.48 
 
 
119 aa  97.8  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  43.52 
 
 
120 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  41.07 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  49 
 
 
163 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  45.36 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  42.75 
 
 
131 aa  94  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  45.1 
 
 
112 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  39.5 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  47.42 
 
 
118 aa  90.5  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.4 
 
 
118 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  44.23 
 
 
115 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  42.34 
 
 
124 aa  90.1  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  44.74 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0031  iojap-like protein  42.99 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.983708  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4639  iojap-like protein  39.32 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188421  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  42.99 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  37.72 
 
 
128 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  43.52 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  39.45 
 
 
125 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  36.61 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  44.66 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  40.74 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  43.33 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  41.35 
 
 
110 aa  87.8  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  44.09 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  42.42 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  42.06 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  42.15 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  36.94 
 
 
117 aa  87.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  42.74 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  43.88 
 
 
110 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  35.4 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  38.1 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  38.33 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2263  iojap-like protein  50 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  46.08 
 
 
118 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  42.22 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  45.05 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  41.41 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  42.22 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1655  iojap-like protein  38.18 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  43.52 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  36.11 
 
 
128 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  43.62 
 
 
139 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  36.67 
 
 
142 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  43.62 
 
 
120 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0986  iojap-like protein  39.29 
 
 
120 aa  83.6  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.254875  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  38.18 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  38.6 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  38.6 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  42.11 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  36.61 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  40.22 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  47.87 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  42.34 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  45.26 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  37.84 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  45.35 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  44.68 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  41.28 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  40 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  42.11 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1339  iojap-like protein  38.74 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  39.25 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  37.38 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  40.22 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  41.32 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  41.28 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  37.96 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  37.96 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  41.41 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  42.53 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4552  iojap-like protein  36.54 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67264  normal  0.570489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  41.24 
 
 
198 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  41.24 
 
 
198 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  41.51 
 
 
226 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  41.05 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  46.08 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  45.74 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  35.71 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  43.53 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  47.37 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  42.53 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  43.02 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  37.38 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  38.32 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>