More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2336 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  97.95 
 
 		 146 aa  292  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  91.89 
 
 		 148 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  93.2 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  93.2 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  93.2 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  85.91 
 
 		 149 aa  246  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  84.31 
 
 		 154 aa  246  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  98.26 
 
 		 154 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  98.26 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  98.26 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  98.26 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  98.26 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  98.26 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  98.26 
 
 		 154 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  79.22 
 
 		 154 aa  233  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  78.95 
 
 		 152 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  76.16 
 
 		 151 aa  223  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  76.03 
 
 		 241 aa  222  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  82.68 
 
 		 205 aa  220  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  82.68 
 
 		 213 aa  220  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  74.48 
 
 		 256 aa  220  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  81.1 
 
 		 203 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  70.15 
 
 		 250 aa  199  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  67.97 
 
 		 274 aa  194  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  67.97 
 
 		 262 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  71.77 
 
 		 221 aa  192  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  64.89 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  66.15 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  67.2 
 
 		 233 aa  184  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  66.13 
 
 		 261 aa  183  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  66.13 
 
 		 189 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  71.55 
 
 		 263 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  70.69 
 
 		 261 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  67.54 
 
 		 289 aa  180  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  69.3 
 
 		 274 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  64.81 
 
 		 121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  60.19 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  58.1 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  53.64 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  53.33 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  48.08 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  47.22 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  47.12 
 
 		 118 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  46.15 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  47.12 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  45.37 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  44.44 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  47.12 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  36.3 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  43 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  46.74 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  46.74 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  46.74 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  39.42 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  39.81 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  42.31 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  42.31 
 
 		 128 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  40.4 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  37.96 
 
 		 109 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  40.38 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  37.04 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  37.96 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  40.4 
 
 		 112 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  39.81 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  39.62 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  41 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  38.32 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  37.61 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.61 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  39.6 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  36.45 
 
 		 109 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  33.33 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  36.89 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  36.89 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  36.21 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  36.89 
 
 		 114 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  36.89 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  36.89 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  36.45 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  36.45 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  36.63 
 
 		 210 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  40.74 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  37.37 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  35.85 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  36.89 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  40 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  34.51 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  47.12 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  44.33 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  36.84 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  37.74 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  39.05 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  36.45 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  39.6 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  37.14 
 
 		 105 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  40.91 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>