More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0255 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  100 
 
 
135 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  89.55 
 
 
210 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  71.72 
 
 
150 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  65.41 
 
 
148 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  71.54 
 
 
141 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  68.47 
 
 
120 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  62.1 
 
 
123 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  52.8 
 
 
142 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  54.62 
 
 
156 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  50.41 
 
 
166 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  58.16 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  50 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  53.4 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  55.88 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  44.93 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  55 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  53.92 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  44.8 
 
 
157 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  53.54 
 
 
156 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  53.06 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  53.54 
 
 
117 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  52.94 
 
 
149 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  52.94 
 
 
147 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  50.91 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  52.88 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  51.65 
 
 
121 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  44.53 
 
 
135 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  49.09 
 
 
153 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  49.06 
 
 
164 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  52.75 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  53.41 
 
 
99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  51.14 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  51.14 
 
 
100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  44.35 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  46.08 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  45.45 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  47.12 
 
 
130 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  52.43 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  51.02 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  51.02 
 
 
106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  43.09 
 
 
146 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  43.81 
 
 
105 aa  103  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  40.18 
 
 
118 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  38.89 
 
 
226 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.67 
 
 
116 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  41.96 
 
 
117 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  47.92 
 
 
148 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  45.26 
 
 
112 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  39.29 
 
 
118 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  42.45 
 
 
109 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  40.57 
 
 
109 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  40.57 
 
 
109 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  38.53 
 
 
109 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  37.61 
 
 
122 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  41.59 
 
 
124 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  42.16 
 
 
114 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  46.88 
 
 
148 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  42.16 
 
 
114 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  40.57 
 
 
109 aa  100  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  43 
 
 
123 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  42.57 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  41.67 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  42.16 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  42.16 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  42.16 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  39.6 
 
 
400 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  52.44 
 
 
110 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  34.19 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  39.58 
 
 
105 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  44.44 
 
 
120 aa  98.6  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  37.39 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  39.58 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  40.4 
 
 
261 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  37.5 
 
 
123 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  40.74 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  38.89 
 
 
109 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  34.35 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  38.68 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  39.29 
 
 
113 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  38.68 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  38.32 
 
 
117 aa  94.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.5 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  38.1 
 
 
105 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  40.59 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  40.38 
 
 
115 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  35.9 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  39.6 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  35.9 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  38.18 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  41.23 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  37.11 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  40.4 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  37.62 
 
 
289 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>