More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0163 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  100 
 
 		 141 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  73.57 
 
 		 148 aa  217  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  70 
 
 		 150 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  81.03 
 
 		 120 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  69.01 
 
 		 210 aa  200  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  71.54 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  72.41 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  54.76 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  61.32 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  61.46 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  55.14 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  56.07 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  58.82 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  52.03 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  57.84 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  57.14 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  49.28 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  61.54 
 
 		 109 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  48.78 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  48.78 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  57 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  59.09 
 
 		 99 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  57.58 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  57.58 
 
 		 117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  54.29 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  55.88 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  57.95 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  57.95 
 
 		 100 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  59.79 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  55.21 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  50.88 
 
 		 164 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  53.06 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  57.8 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  56.25 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  54.29 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  54.29 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  55.45 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  50 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  48.62 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  46.83 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  57.3 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  46.94 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  46.23 
 
 		 123 aa  105  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  43.56 
 
 		 400 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  44.34 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  45.19 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  45.19 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  45.54 
 
 		 118 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  44.76 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  44.12 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  44.12 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  44.44 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  44.12 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  44.12 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  46.43 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  46.39 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  44.55 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  42.86 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  42.86 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  42.86 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  42.86 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  45.71 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  45.54 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  41.28 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  43.27 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  44.79 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  45.54 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  44.79 
 
 		 226 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  42.16 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  42.31 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  46.15 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  43.14 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  40.78 
 
 		 117 aa  98.6  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  40.8 
 
 		 150 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  43.14 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  43.4 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  44.12 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  44.55 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  42.86 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  41.58 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  42.72 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  47.75 
 
 		 117 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  40.21 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>