More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2518 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  100 
 
 		 110 aa  224  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  77.65 
 
 		 164 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  77.65 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  77.65 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  72.09 
 
 		 110 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  63.64 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  69.51 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  65.52 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  58.7 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  65.85 
 
 		 143 aa  117  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  59.34 
 
 		 168 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  57.14 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  55.81 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  56.63 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  59.77 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  55.81 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  55.81 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  55.81 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  59.3 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  58.54 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  56.52 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  56.98 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  57.3 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  54.76 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  50 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  61.25 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  56.63 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  54.88 
 
 		 99 aa  103  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  54.88 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  55 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  55 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  55 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  57.5 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  54.88 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  51.16 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  52.44 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  51.22 
 
 		 210 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  51.25 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  50 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  48.84 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  47.56 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  48.31 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  40.2 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  48.31 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  42.68 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  45.05 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  44.44 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  43.82 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  48.81 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  41.11 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.11 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  46.59 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  43.9 
 
 		 400 aa  84.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  41.46 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  40.24 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  41.84 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  38.24 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  39.08 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  43.9 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  39.39 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.13 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  39.39 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  39.39 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  43.82 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  39.13 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  38.2 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  37.36 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  42.22 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  45 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  36.46 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  37.78 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  46.75 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  40.24 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  38.82 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  37.8 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  35.29 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0789  Iojap-related protein  38.1 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  48.78 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  43.9 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  44.09 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  42.68 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  43.21 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  42.68 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  42.68 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  40.24 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  42.68 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  42.68 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  39.33 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  42.68 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  35.92 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  42.68 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  38.46 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  43.24 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  37.93 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  39.02 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  37.93 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  38.82 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  42.68 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0124  iojap-like protein  43.53 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000225979  hitchhiker  0.00822144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>