More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2127 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  100 
 
 		 130 aa  263  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  61.24 
 
 		 125 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  59.26 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  54.24 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  58.33 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  52.42 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  57.41 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  56.73 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  56.73 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  55.77 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  55.77 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  54.13 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  56.03 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  57.69 
 
 		 105 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  52.21 
 
 		 123 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  56.03 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  51.38 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  60 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  57.28 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  51.38 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  51.38 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  51.38 
 
 		 114 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  49.14 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  53.85 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  53.85 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  53.85 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  51.75 
 
 		 173 aa  121  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  53.85 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  50.85 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  50.85 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  54.81 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  50.85 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  54.81 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  53.85 
 
 		 115 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  49.56 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  51.92 
 
 		 106 aa  118  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  52.88 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  51.92 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  54.81 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  50.94 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  50.96 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  45.9 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  51.82 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  51.82 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  49.49 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  49.04 
 
 		 105 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  49.49 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  49.04 
 
 		 105 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  44.72 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  49.04 
 
 		 105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  50.96 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  44.72 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  49.55 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  47.17 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  49.04 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  49.04 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  49.04 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  48.08 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  44.23 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  48.62 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  50.48 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  50.96 
 
 		 105 aa  112  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  50 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  47.12 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  49.51 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  50 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  47.12 
 
 		 105 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  49.52 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  52.17 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  47.12 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  48.57 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  46.15 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  46.3 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  50 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  46.6 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  46.79 
 
 		 168 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  47.12 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  45.71 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  47.75 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  44.66 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  48.08 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  47.17 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01878  domain of unknown function superfamily  53.98 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>