More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0857 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  80.73 
 
 		 109 aa  193  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  81.65 
 
 		 109 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  79.82 
 
 		 114 aa  190  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  79.82 
 
 		 114 aa  190  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  79.82 
 
 		 114 aa  190  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  83.96 
 
 		 109 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  83.96 
 
 		 109 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  83.02 
 
 		 114 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  83.02 
 
 		 114 aa  188  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  75.93 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  76.15 
 
 		 115 aa  175  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  77.36 
 
 		 108 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  72.48 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  72.64 
 
 		 109 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  70.64 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  65.71 
 
 		 105 aa  149  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  60 
 
 		 105 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  60 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  60 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  55.24 
 
 		 105 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  55.24 
 
 		 105 aa  136  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  56.19 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  58.1 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  56.19 
 
 		 105 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  54.72 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  56.19 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  57.14 
 
 		 105 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  47.17 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  52.38 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  51.38 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  123  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  53.85 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  49.04 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  48.08 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  48.08 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  50 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  50.48 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  43.4 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  49.5 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  48.57 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  52.94 
 
 		 137 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  45.19 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  52.83 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  50.48 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  52.58 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  47 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  45.28 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  51.55 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  52.48 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  50.52 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  51.52 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  52.88 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  47.52 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  48.57 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  47 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  47 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  47 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  42.31 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  45.63 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  42.31 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  44.55 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  45 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  44 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  43 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  43.56 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  44.34 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  42.86 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  43.14 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  42 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  40.57 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  41.84 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  44.86 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  40.95 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  40.95 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  40.59 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  40 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  45.83 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  45.83 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  38.68 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2850  iojap-like protein  49.52 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0776144  hitchhiker  0.0000000811446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  41.24 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  40.82 
 
 		 210 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  42.53 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>