More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3646 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  100 
 
 
150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  55.21 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  50 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  53.15 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  50 
 
 
128 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  53.91 
 
 
119 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  50.43 
 
 
131 aa  116  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  46.55 
 
 
131 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  50 
 
 
109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  50 
 
 
109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  52 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  52 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  52.48 
 
 
109 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  44.83 
 
 
128 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  45.95 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  43.97 
 
 
128 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  45.37 
 
 
163 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  39.85 
 
 
138 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  51.58 
 
 
118 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  48.48 
 
 
105 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  42.96 
 
 
148 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  47.22 
 
 
109 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  40.35 
 
 
122 aa  103  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  41.86 
 
 
191 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  50 
 
 
118 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  48.48 
 
 
105 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  48.39 
 
 
198 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  47.06 
 
 
107 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  48.39 
 
 
198 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  42.22 
 
 
148 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  52.04 
 
 
124 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  45.37 
 
 
109 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  47 
 
 
114 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  47 
 
 
114 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  47 
 
 
114 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.95 
 
 
118 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  53.61 
 
 
139 aa  100  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  52.22 
 
 
121 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  44.14 
 
 
116 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  42.98 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  49.46 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  40.44 
 
 
210 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  44.14 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  44.8 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  38.24 
 
 
148 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  40.35 
 
 
128 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  39.64 
 
 
114 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  40.8 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  38.74 
 
 
119 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  41.44 
 
 
117 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08901  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  46.73 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116014 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  43.96 
 
 
226 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  50.54 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  42.11 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  47.27 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  45.19 
 
 
130 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  48.62 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  52.13 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  44.64 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  50.54 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  46.07 
 
 
113 aa  97.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  45.28 
 
 
108 aa  97.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0838  Iojap-related protein  47.27 
 
 
121 aa  97.1  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  44.09 
 
 
166 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  43.4 
 
 
109 aa  97.1  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06010  iojap-related protein  42.37 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0403792  hitchhiker  0.0000000000582879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  45.28 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  45.26 
 
 
109 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  48.45 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  41.51 
 
 
109 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  43.4 
 
 
123 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  41.07 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  43.81 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  47.06 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  45.16 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  43.3 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  50.53 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  46.94 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  42.34 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  44.12 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  38.94 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  47.31 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  44.09 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  45.79 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  40.54 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  44.76 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  44.04 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  50.54 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>