More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2577 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  52.21 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  50 
 
 
128 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  54.55 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  46.96 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  46.09 
 
 
128 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  53.91 
 
 
150 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  48.62 
 
 
131 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  43.36 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000986152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  49.53 
 
 
107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  46.02 
 
 
191 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  50.94 
 
 
166 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  51 
 
 
198 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  51 
 
 
198 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  45.63 
 
 
124 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09441  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  44.44 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.120716  hitchhiker  0.0000153571 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  49.06 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  48.18 
 
 
117 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08901  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  42.99 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  42.48 
 
 
125 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0164  Iojap-related protein  48.48 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  46.88 
 
 
114 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0224  Iojap-related protein  45.45 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.739057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  42.06 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  36.45 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  43.69 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13821  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  44.34 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.116188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  47.62 
 
 
118 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0838  Iojap-related protein  46.23 
 
 
121 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  44.23 
 
 
144 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  41.96 
 
 
139 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  40.87 
 
 
118 aa  94  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  45 
 
 
104 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  39.6 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  46.67 
 
 
118 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  43.43 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  44.34 
 
 
131 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  50.55 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  45.28 
 
 
105 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  45.54 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  47.42 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  46 
 
 
118 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  38.32 
 
 
116 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  43.93 
 
 
109 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  46.81 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  39.25 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  44.21 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0087  Iojap-related protein  45.45 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.755827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  45.37 
 
 
118 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  43.93 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  48.86 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  48.31 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  46.32 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  41.23 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  42.2 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  46.32 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  41.23 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  47.78 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  41.23 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  38.32 
 
 
114 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  47.37 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  39.45 
 
 
109 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0735  Iojap-related protein  40.37 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  39.25 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  42.99 
 
 
131 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.87 
 
 
118 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5475  iojap-like protein  43.96 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219146  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  42.99 
 
 
144 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  47.19 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  42.27 
 
 
226 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5041  iojap-like protein  38.79 
 
 
127 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  40.54 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  42.15 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  47.83 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  47.83 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  47.83 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  47.83 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  38.74 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  46.81 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  42.48 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  43.12 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  39.58 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  39.09 
 
 
135 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  44.04 
 
 
123 aa  87  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2452  iojap-like protein  41.41 
 
 
134 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.344945  normal  0.138235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  41.05 
 
 
210 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  43.3 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0102  iojap-like protein  44.68 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000101684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  41.35 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  45.74 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  43.3 
 
 
120 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  45.05 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  46.32 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  42.55 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  43.16 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  42.31 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  44.44 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  42.55 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4552  iojap-like protein  40.19 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67264  normal  0.570489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  42.86 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>