More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3706 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  100 
 
 		 109 aa  219  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  84.4 
 
 		 109 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  85.19 
 
 		 109 aa  191  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  80.73 
 
 		 115 aa  191  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  77.57 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  77.57 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  76.15 
 
 		 109 aa  178  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  76.64 
 
 		 114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  76.64 
 
 		 114 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  72.48 
 
 		 109 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  71.56 
 
 		 114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  71.56 
 
 		 114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  71.56 
 
 		 114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  70.64 
 
 		 109 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  70.64 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  65.09 
 
 		 109 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  61.9 
 
 		 105 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  60.58 
 
 		 105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  53.77 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  52.88 
 
 		 105 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  120  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  54.81 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  51.92 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  48.62 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  50.48 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  51.92 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  47.17 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  47.22 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  48.57 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  48.57 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  48.57 
 
 		 105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  51.92 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  50.96 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  47.62 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  50.96 
 
 		 105 aa  116  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  50.96 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  55.88 
 
 		 137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  54.17 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  45.87 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  45.71 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  46.15 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  53.12 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  46.15 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  49.02 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  48.08 
 
 		 115 aa  103  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  48.51 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  47.12 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  46.08 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  46.88 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  43.4 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  46.88 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  41.58 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  42.31 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  46.15 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  48.96 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  39 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  43.56 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  44.76 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  44.76 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  43.12 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  46.15 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  43.12 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  42.72 
 
 		 168 aa  95.9  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  41.51 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  45.83 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  42.59 
 
 		 241 aa  95.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  47.25 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  48 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  47.25 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  39.81 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  40.74 
 
 		 203 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  39.45 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  45.16 
 
 		 226 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  41.35 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  41.67 
 
 		 205 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  41.41 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  43.3 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  45.54 
 
 		 117 aa  93.6  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  41.67 
 
 		 213 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  44.23 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  41.67 
 
 		 256 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  46.15 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  40.74 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  45.65 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  40.74 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>