More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4278 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  276  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  75.91 
 
 		 147 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  75.91 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  73.72 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  63.24 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  62.5 
 
 		 168 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  60.71 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  55.08 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  58.88 
 
 		 156 aa  140  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  61.54 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  58.88 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  60.4 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  57.27 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  58.82 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  59.18 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  51.97 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  56.25 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  61.17 
 
 		 110 aa  133  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  51.13 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  60.2 
 
 		 153 aa  131  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  54.46 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  56.57 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  59.18 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  54.9 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  62.11 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  62.11 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  58 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  56.12 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  55.88 
 
 		 210 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  59.57 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  55.88 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  55.34 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  58 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  56.18 
 
 		 99 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  50.91 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  53 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  57.3 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  57.3 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  55.81 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  50 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  50.51 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  50.51 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  40.19 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  42.86 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  44.66 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  39.25 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  42.72 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  44 
 
 		 400 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  42.72 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  42.72 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  42.72 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  42.72 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  43.69 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  43.43 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  41.12 
 
 		 117 aa  96.7  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  42.98 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  42.27 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  41.18 
 
 		 226 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  45.79 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  42.72 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  39.25 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  40.82 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  41.84 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  41.24 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  48 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  42.72 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  40.78 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  42.27 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  40.78 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  40.78 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  40.78 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  34.45 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  41 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  44.44 
 
 		 148 aa  93.6  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  39.05 
 
 		 123 aa  93.2  9e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  41.75 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  43.96 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  39.8 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  40.59 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  38.83 
 
 		 105 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  41.76 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  41.84 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  37.61 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  37.86 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  37.86 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  43.43 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  35.92 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>