More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0087 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  100 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  70.64 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  68.81 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  74.26 
 
 		 106 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  74.26 
 
 		 106 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  66.67 
 
 		 153 aa  155  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  64.55 
 
 		 168 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  72.09 
 
 		 110 aa  137  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  60.4 
 
 		 132 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  60.78 
 
 		 135 aa  136  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  61.17 
 
 		 137 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  67.01 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  62.5 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  58.65 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  58.65 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  57.84 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  60.58 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  59.62 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  55.34 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  57.8 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  58.16 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  54.13 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  58.51 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  53.77 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  52.94 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  52.63 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  52.63 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  54.9 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  52.63 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  52.94 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  51.49 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  55.34 
 
 		 210 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  52.13 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  50.98 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  53.06 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  54.02 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  54.02 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  54.02 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  52.87 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  44.79 
 
 		 105 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  44.79 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  48.35 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  51.72 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  41.75 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  38.71 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.22 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  51.72 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  43.14 
 
 		 400 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  39.22 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  52.27 
 
 		 117 aa  94  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  41.12 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  40.2 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  51.14 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  40.59 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  40.59 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  40.59 
 
 		 139 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  47.96 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  40.62 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  44.68 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  42.86 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  45.05 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  43.75 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  43.48 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  40 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  44.33 
 
 		 226 aa  90.5  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  40.4 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  43.75 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  38.54 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  42.71 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  41.18 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  37.36 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  38.24 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  42.71 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  42.71 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  40.2 
 
 		 117 aa  89  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  42.71 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1117  iojap-related protein  38.46 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  41.18 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  38.83 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  40.21 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>