More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2544 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  100 
 
 
135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0577  Iojap-related protein  78.95 
 
 
132 aa  187  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.258721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  75.63 
 
 
153 aa  178  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  60.78 
 
 
110 aa  136  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  58.88 
 
 
164 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2990  iojap-like protein  52.46 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.923836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  55.56 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  60.75 
 
 
143 aa  131  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0865  hypothetical protein  59.8 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2525  iojap-like protein  59.8 
 
 
106 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52236  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1236  Iojap-related protein  58.88 
 
 
138 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  59.22 
 
 
153 aa  130  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2506  Iojap-related protein  56.86 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  55.96 
 
 
168 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  56.73 
 
 
120 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4220  iojap-like protein  57.14 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2518  iojap-like protein  65.52 
 
 
110 aa  123  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  50.91 
 
 
137 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  52.68 
 
 
142 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  55.05 
 
 
156 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4730  iojap-like protein  59.57 
 
 
109 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3096  iojap-like protein  55 
 
 
100 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0645732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  45.6 
 
 
150 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2870  iojap-like protein  55 
 
 
100 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  50 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  55.67 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  56.7 
 
 
99 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  48.18 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  48.18 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  51.55 
 
 
123 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  48.08 
 
 
210 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  47.71 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  47.71 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  48.08 
 
 
135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  57.28 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  51.49 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  48.94 
 
 
159 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0321  iojap-like protein  53.68 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  45.16 
 
 
146 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1083  iojap-like protein  42.16 
 
 
400 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0346  iojap-related protein  39.22 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  42.72 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  45 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  39.42 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  40.78 
 
 
118 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  39.22 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0662  Iojap-related protein  35.51 
 
 
118 aa  92  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  38.24 
 
 
115 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  45.54 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  44.12 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  42.42 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  39.81 
 
 
118 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  39.42 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  36.28 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  38.83 
 
 
118 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  35.4 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  44.21 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  39.05 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  37.84 
 
 
256 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  35.4 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  44.21 
 
 
112 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  35.4 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  35.4 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  45.45 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  38.68 
 
 
241 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  34.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  35.4 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  43.33 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  46.08 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  35.4 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  39.42 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  34.51 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  34.51 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  34.51 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  41 
 
 
226 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  34.51 
 
 
203 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  44.44 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  34.51 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  37.89 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  38.89 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  34.51 
 
 
213 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  34.51 
 
 
205 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  39.05 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  39 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  35.92 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  35 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  38.61 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  41.67 
 
 
118 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  35.51 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  38.6 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  34.95 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  34.91 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>