More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1159 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  100 
 
 
117 aa  240  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  75.21 
 
 
117 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  75.21 
 
 
117 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  54.95 
 
 
118 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  54.05 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  59.26 
 
 
118 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4450  iojap-related protein  55.08 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0295288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0787  iojap-related protein  55.08 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000071595  hitchhiker  0.00000138621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4411  iojap-related protein  54.24 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0836383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4066  iojap-related protein  54.24 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.08408e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4076  iojap-related protein  54.24 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000293892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4463  iojap-related protein  54.24 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4352  iojap-related protein  54.24 
 
 
118 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00200465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4181  iojap-like protein  56.48 
 
 
118 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000680321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4228  iojap-related protein  53.39 
 
 
118 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4556  iojap-related protein  53.39 
 
 
118 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  45.37 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  42.2 
 
 
118 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  42.99 
 
 
115 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  44.86 
 
 
117 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  41.28 
 
 
118 aa  104  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  41.44 
 
 
118 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1233  iojap-like protein  47.71 
 
 
118 aa  103  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000702287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  38.68 
 
 
117 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  39.45 
 
 
112 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  41.82 
 
 
113 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  43.81 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  38.53 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  40.52 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  41.67 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  44.95 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  40.95 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  41.35 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  34.58 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2674  iojap-like protein  35.34 
 
 
124 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0269937  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0234  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  93.6  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  38.53 
 
 
125 aa  92  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  44.94 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  45.05 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  43.62 
 
 
127 aa  90.1  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  45.98 
 
 
121 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  37.86 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  37.38 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  37.38 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  38.68 
 
 
163 aa  88.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  38.46 
 
 
106 aa  88.2  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  37.11 
 
 
110 aa  88.2  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  36.45 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3359  iojap-like protein  39.05 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  38.53 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37.38 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  36.94 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  37.72 
 
 
173 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  38.95 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3449  iojap-like protein  40.59 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467632  normal  0.645308 
 
 
-
 
NC_002936  DET0393  iojap-like protein  36.11 
 
 
114 aa  85.5  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00274134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  39.29 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  41.9 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  39.18 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  38.71 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  38.71 
 
 
198 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  36.7 
 
 
119 aa  84.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5603199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2807  iojap-like protein  42.05 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1756  Iojap-related protein  38.71 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000663767  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0233  hypothetical protein  38.18 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  38.89 
 
 
128 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3002  iojap-like protein  37.84 
 
 
131 aa  84.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  35.19 
 
 
109 aa  84.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  36.45 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  37.5 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1817  Iojap-related protein  36.79 
 
 
118 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  37.96 
 
 
128 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  39.42 
 
 
130 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  37.93 
 
 
135 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000208423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  37.04 
 
 
116 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  37.38 
 
 
122 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  36.11 
 
 
115 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0372  iojap-like protein  36.11 
 
 
114 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000445596  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  33.33 
 
 
109 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  37.86 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  38.38 
 
 
104 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  37.63 
 
 
191 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  38.74 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  38.18 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  34.58 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  38.46 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  39.05 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  41.11 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  39.64 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  31.78 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  36.45 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_335  hypothetical protein  36.73 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  34.26 
 
 
109 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  34.26 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  37.23 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  37.38 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  34.44 
 
 
114 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  37.27 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  36.54 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  35.58 
 
 
122 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>