More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2544 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2544  iojap-like protein  100 
 
 
120 aa  238  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00643892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  49.09 
 
 
117 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  49.06 
 
 
118 aa  110  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000139024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  47.27 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000123789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  44.07 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  43.12 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000207265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0997  iojap-like protein  45.19 
 
 
118 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  43.81 
 
 
113 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2454  iojap-like protein  44.23 
 
 
118 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  44.55 
 
 
117 aa  103  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1366  iojap-like protein  49.09 
 
 
114 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  42.34 
 
 
115 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  37.61 
 
 
118 aa  100  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000042805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1753  iojap-like protein  39.82 
 
 
122 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1736  Iojap family protein  40.91 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  42.11 
 
 
110 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1659  iojap-related protein  39.05 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000807789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1159  iojap-related protein  40.95 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3248  iojap-like protein  43.52 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000025477  unclonable  0.0000142145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1684  hypothetical protein  40.95 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0432873  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1649  hypothetical protein  40.95 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0058  Iojap-related protein  44.44 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  39.09 
 
 
120 aa  94  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1401  Iojap family protein  35.71 
 
 
121 aa  93.6  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131748  hitchhiker  5.83181e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  38.89 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4329  iojap-like protein  39.22 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.9777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  43.52 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  45.63 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  45 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3737  iojap-like protein  44.79 
 
 
104 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000069668  unclonable  0.000000000198678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  41.88 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3193  iojap-like protein  43.52 
 
 
120 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  36.84 
 
 
144 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.69 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  44.55 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3534  iojap-like protein  39.09 
 
 
133 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3529  Iojap-related protein  39.09 
 
 
122 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3602  iojap-like protein  39.09 
 
 
122 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158813  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  46 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1601  iojap-related protein  39.8 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000667428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2654  iojap-like protein  43.43 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2225  iojap-like protein  42.2 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.194852  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  41.75 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1923  iojap-like protein  38.38 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000477061  unclonable  0.00000000896903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0933  iojap-like protein  41.18 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.139948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  40.78 
 
 
118 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  36.54 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000588564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  39.81 
 
 
116 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3925  iojap-like protein  43.16 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1637  iojap-like protein  45.65 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.418914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3118  iojap-like protein  37.25 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  40.16 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  40.16 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0977  Iojap-related protein  39.64 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  37.93 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  40.16 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  43.3 
 
 
131 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  44.44 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0755  iojap-like protein  42.42 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.307154  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12448  hypothetical protein  41.41 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.873041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  37.96 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5246  iojap-like protein  43.01 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378223  normal  0.556736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  41.18 
 
 
130 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  39.8 
 
 
137 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3002  iojap-like protein  36.27 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404197  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  41.75 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  44.33 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000201224  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  40.78 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  40.57 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11590  iojap-related protein  41.18 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.633601 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08981  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  37.84 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40.37 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1761  iojap-like protein  37.04 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0136  iojap-like protein  37.04 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.872852  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  42.27 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  42.27 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  39.22 
 
 
168 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  41.38 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0399  iojap-like protein  39.09 
 
 
116 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000418488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  46.74 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2299  iojap-like protein  40.23 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000554928  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10471  domain of unknown function DUF143:Iojap-related protein  40.57 
 
 
114 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.176086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  33.64 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0838  Iojap-related protein  36.75 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  37.14 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000027247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  40.78 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  37.96 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3056  iojap-like protein  43.1 
 
 
118 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000232499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  42.57 
 
 
120 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  38.84 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  41.67 
 
 
150 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0612  hypothetical protein  41.24 
 
 
125 aa  84  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  40.4 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000149501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2544  iojap-like protein  39.05 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139238  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7257  iojap-like protein  39.09 
 
 
173 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  37.76 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  43.56 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  37.76 
 
 
107 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  43.01 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  39.25 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>