More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0170 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  64.55 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  65.74 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  63.64 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  63.64 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  63.64 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  64.81 
 
 		 146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  64.81 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  62.96 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  64.04 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  63.64 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  62.96 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  62.73 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  63.89 
 
 		 203 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  62.04 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  60.91 
 
 		 213 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  60.87 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  57.02 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  57.89 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  56.48 
 
 		 241 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  55.56 
 
 		 256 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  51.72 
 
 		 250 aa  140  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  60.95 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  54.21 
 
 		 263 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  54.21 
 
 		 261 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  53.85 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  52.34 
 
 		 274 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  52.34 
 
 		 262 aa  134  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  54.21 
 
 		 261 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  50.47 
 
 		 233 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  49.53 
 
 		 289 aa  129  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  50.47 
 
 		 274 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  49.53 
 
 		 221 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  54.05 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  52.73 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  51.75 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  54.95 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  47.86 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  45.83 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  45.83 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  48.15 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  42.15 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  44.25 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  45.87 
 
 		 123 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  48 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  43.64 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  45.63 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  44.86 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  45.63 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  49 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  44.34 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  47.62 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  41.67 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  46.15 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  43 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  44.04 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  43.12 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  42.72 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  41.28 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  40.37 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  41.9 
 
 		 115 aa  97.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  42.06 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  38.05 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  44.55 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  40.95 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  38.1 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  40 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  40 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  40.59 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  40.59 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  39.45 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  41.9 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  40.95 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  40.95 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  40.95 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  40.37 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  43.56 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  39.6 
 
 		 135 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>