More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1706 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1706  iojap-like protein  100 
 
 
262 aa  500  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0218041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1901  iojap-like protein  91.19 
 
 
274 aa  350  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3200  iojap-like protein  87.05 
 
 
263 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2625  iojap-like protein  62.03 
 
 
233 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247151  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3524  iojap-like protein  83.21 
 
 
261 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395947  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2687  iojap-like protein  70.3 
 
 
221 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0645219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2079  Iojap-related protein  80.77 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1732  iojap-like protein  68.99 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1972  Iojap-related protein  60.59 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.972723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1341  hypothetical protein  80.7 
 
 
189 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  67.83 
 
 
146 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  64.58 
 
 
146 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1949  iojap-like protein  73.28 
 
 
250 aa  201  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  72.41 
 
 
148 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  71.55 
 
 
147 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  71.55 
 
 
147 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  71.55 
 
 
147 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  62 
 
 
154 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  68.25 
 
 
203 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  71.05 
 
 
154 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  71.05 
 
 
154 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  71.05 
 
 
154 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  71.05 
 
 
154 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  71.05 
 
 
154 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  71.05 
 
 
154 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  71.05 
 
 
154 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  70.94 
 
 
152 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  70.69 
 
 
149 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2526  Iojap-related protein  60.76 
 
 
241 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0781  Iojap-related protein  51.5 
 
 
256 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11902  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  67.46 
 
 
205 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  67.46 
 
 
213 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  55.28 
 
 
154 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  66.67 
 
 
151 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  57.76 
 
 
129 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  55.04 
 
 
130 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  52.34 
 
 
121 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  53.06 
 
 
117 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  50.47 
 
 
115 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  40.29 
 
 
158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  45.87 
 
 
119 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  41.58 
 
 
115 aa  95.9  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  40.95 
 
 
114 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  41.96 
 
 
116 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  39.13 
 
 
140 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  43.96 
 
 
139 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07936  hypothetical protein  40 
 
 
123 aa  91.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  35.09 
 
 
150 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  43.96 
 
 
158 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  34.65 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  43.96 
 
 
139 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  37.17 
 
 
156 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  43 
 
 
118 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  43 
 
 
118 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  39.6 
 
 
105 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  43.96 
 
 
122 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  40.18 
 
 
123 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  37.86 
 
 
123 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  39.56 
 
 
123 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  39.56 
 
 
128 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  37.5 
 
 
109 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  39.56 
 
 
164 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  36.63 
 
 
135 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  34.55 
 
 
148 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  35.92 
 
 
109 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  36.89 
 
 
109 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  37.5 
 
 
115 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  35.92 
 
 
114 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1328  hypothetical protein  36.84 
 
 
112 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  38.68 
 
 
123 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  35.92 
 
 
109 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  35.92 
 
 
109 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  40 
 
 
105 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  35.29 
 
 
108 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  43.62 
 
 
117 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  39 
 
 
105 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  36.63 
 
 
105 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2006  iojap-like protein  44.09 
 
 
142 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0014366  hitchhiker  0.0000000000365534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1332  hypothetical protein  36.84 
 
 
112 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  38.32 
 
 
120 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  32.73 
 
 
141 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  35.51 
 
 
109 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  36.54 
 
 
109 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2601  iojap-like protein  37.86 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.378393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  34.62 
 
 
109 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  35.16 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  37 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  35.16 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  38.68 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000289548  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  38.3 
 
 
128 aa  82  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000489424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  33.02 
 
 
109 aa  82  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  38.38 
 
 
105 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  38.38 
 
 
105 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  31.58 
 
 
164 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  36.27 
 
 
150 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>