More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4862 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  100 
 
 		 158 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  87.86 
 
 		 140 aa  248  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  78.03 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  70.4 
 
 		 128 aa  186  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  70.94 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  58.12 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  60.18 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  57.63 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  56.78 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  50.85 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  50 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  44.17 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  50 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  51 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  47.37 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  48.51 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  48.08 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2908  iojap-like protein  45.45 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  45.61 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  50.52 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1313  iojap-like protein  47.12 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  47.12 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  53 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  103  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  45.63 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  47 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  49.45 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  49.45 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  50.55 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  44.86 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  53.26 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  48.89 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  48.35 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  45.1 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  47.06 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  47.96 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  47 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  47.25 
 
 		 105 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  47.78 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2274  iojap-like protein  54.46 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.547969  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  50 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  50 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  45.1 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2140  iojap-like protein  45.63 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  46.15 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  46.15 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  46.67 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2850  iojap-like protein  50.91 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0776144  hitchhiker  0.0000000811446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  46.15 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  46.15 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  46.15 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  46.15 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  46.15 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  46.15 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  45.45 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  44.04 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1761  iojap-like protein  43.69 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0377  Iojap-related protein  44.04 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  46.74 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  48.91 
 
 		 203 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  46.74 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  47.83 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0987  hypothetical protein  40.66 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  43.56 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2068  iojap-like protein  47.83 
 
 		 152 aa  94  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.286889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  46.74 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  46.74 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  46.74 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  42.72 
 
 		 115 aa  94  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  46.74 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  42.72 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0156  iojap-like protein  44.55 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  35.9 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0446  Iojap-related protein  41.58 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.284133  normal  0.877531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  47 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>