More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0485 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0485  Iojap-related protein  100 
 
 
120 aa  246  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.40385e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  49.53 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  49.53 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000143508  hitchhiker  0.000000000478913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  52.83 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  49.52 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000119797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1137  iojap-like protein  50.96 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000812131  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1543  Iojap-related protein  45.38 
 
 
123 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0158973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  49.52 
 
 
114 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316802  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  49.52 
 
 
114 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000132969  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2867  iojap-like protein  49.53 
 
 
109 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000086194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1170  iojap domain-containing protein  47.66 
 
 
109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1562  iojap-like protein  50.96 
 
 
105 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.985002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0993  iojap-like protein  47.62 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000971305  normal  0.0937197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1058  iojap-like protein  47.62 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000229081  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0997  iojap-like protein  47.62 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000184153  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2440  Iojap-related protein  49.56 
 
 
117 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  47.12 
 
 
123 aa  106  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2586  iojap domain-containing protein  49.52 
 
 
108 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000697602  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0170  Iojap-related protein  43.64 
 
 
121 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  48.08 
 
 
105 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  45.05 
 
 
115 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  49.04 
 
 
105 aa  103  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3821  iojap-like protein  46.3 
 
 
115 aa  103  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2962  hypothetical protein  48.08 
 
 
105 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3147  iojap-like protein  45.37 
 
 
109 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000880611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0593  Iojap-related protein  45.61 
 
 
119 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.328156 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1846  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000107419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000295107  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3148  hypothetical protein  48.08 
 
 
105 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2947  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0112244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3019  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000113985  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000777395  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000919857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000122967  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0612  iojap-like protein  46.15 
 
 
140 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527237  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  46.3 
 
 
114 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574363  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3483  iojap-like protein  44.95 
 
 
109 aa  101  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000176434  unclonable  0.0000000000377675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1172  hypothetical protein  45.71 
 
 
105 aa  100  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149943  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  44.76 
 
 
105 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2933  iojap-like protein  46.73 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000045875  decreased coverage  0.00669714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1717  iojap-related protein  43.27 
 
 
106 aa  100  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0361  Iojap-related protein  48.42 
 
 
158 aa  100  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2127  iojap-like protein  48.08 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.810786  normal  0.0331873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1739  iojap-like protein  43.86 
 
 
173 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4862  iojap-like protein  47.96 
 
 
139 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376874  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4809  iojap-like protein  47.96 
 
 
139 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.243454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4684  iojap-like protein  46.53 
 
 
158 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1203  hypothetical protein  44.76 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.718805  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2415  iojap-like protein  44.14 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000527491  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  46.15 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3706  iojap-like protein  43.12 
 
 
109 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000743073  decreased coverage  0.000000204323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  45.71 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000504193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  45.19 
 
 
105 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0194  hypothetical protein  43.14 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0193009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4972  hypothetical protein  48.94 
 
 
164 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05158  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2194  hypothetical protein  41.67 
 
 
203 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0214  Iojap-related protein  42.16 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1992  iojap-like protein  41.67 
 
 
213 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0989402  normal  0.862271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0614  iojap-like protein  38.89 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2392  iojap-like protein  41.67 
 
 
205 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177985  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1241  iojap-like protein  37.96 
 
 
130 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5625  Iojap-related protein  38.89 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0666  iojap family protein  38.68 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  2.49784e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  43.81 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1511  iojap protein family  38.68 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000252813  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2321  iojap-like protein  38.89 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.891424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1686  Iojap-related protein  38.89 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0343  iojap-like protein  46.39 
 
 
134 aa  91.3  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000185203  unclonable  0.000000000186984 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2298  iojap-like protein  38.89 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3263  Iojap-related protein  37.96 
 
 
151 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.874451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1297  iojap-like protein  37.96 
 
 
154 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.605705  normal  0.0750793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2336  iojap-like protein  37.96 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  42.86 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000675973  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2215  iojap-like protein  37.96 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  40.71 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0980  iojap-like protein  38.89 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0276771  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  38.68 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1380  hypothetical protein  48.39 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  42.72 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1888  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.791339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1381  iojap superfamily protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.601287  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0354  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.623814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1011  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0796  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08370  iojap-related protein  42.86 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0216142  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0323  hypothetical protein  45.83 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0834924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1227  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  42.86 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1071  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1236  iojap domain-containing protein  37.96 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.757129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3346  iojap-like protein  42.57 
 
 
226 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000242927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>