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for query gene Rmet_0777 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 418 aa  822    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  70.91 
 
 		 424 aa  584  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.63 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.51 
 
 		 400 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  44.69 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  47.01 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.95 
 
 		 409 aa  280  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.34 
 
 		 408 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1038  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.25 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.614321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1035  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.25 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.69 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.83 
 
 		 410 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.01 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.01 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.41 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.36 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.58 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1677  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.05 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.701434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.18 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  40.35 
 
 		 353 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.81 
 
 		 404 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.02 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01910  arabinose efflux permease family protein  34.85 
 
 		 435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  35.76 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  35.37 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.94 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.67 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.61 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.38 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  33.77 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.79 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.84 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.2 
 
 		 393 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.83 
 
 		 417 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.07 
 
 		 398 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.67 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.85 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.58 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.72 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.67 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.33 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.68 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.19 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.19 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 419 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  34.19 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.82 
 
 		 398 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  34.19 
 
 		 416 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.44 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.22 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.74 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  33.82 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3062  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.37 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.67 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.63 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.77 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.39 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  31.14 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.08 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
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NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.32 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.2 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.05 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.14 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.12 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  30.61 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.12 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  29.66 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.12 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.31 
 
 		 415 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  29.64 
 
 		 397 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.93 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.36 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.42 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.95 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.22 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.14 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  28.65 
 
 		 426 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.53 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.72 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 398 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.67 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.64 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.35 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_4159  MFS permease  31.25 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A2033  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_1058  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
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NC_006349  BMAA1774  Bcr/CflA family drug resistance transporter  29.45 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.5 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
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NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  30.95 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.97 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
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