More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1049 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 402 aa  817    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  68.91 
 
 		 409 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  68.21 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  67.44 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  67.44 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  67.69 
 
 		 397 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 404 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  67.95 
 
 		 397 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  68.54 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  67.17 
 
 		 405 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  66.84 
 
 		 404 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  65.65 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  68.54 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  67.01 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 407 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0072  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 		 404 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00296113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  65.75 
 
 		 403 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  66.25 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  66.75 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  67.53 
 
 		 409 aa  531  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  65.14 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0063  tryptophan synthase subunit beta  65.82 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  64.95 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  68.3 
 
 		 404 aa  531  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  65.9 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  67.44 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0776  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 400 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  65.22 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  65.49 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1838  tryptophan synthase, beta subunit  64.91 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.425448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0535  tryptophan synthase subunit beta  66.07 
 
 		 399 aa  529  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000244592  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  66.67 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  64.5 
 
 		 404 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0673  tryptophan synthase subunit beta  64.96 
 
 		 400 aa  529  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  65.13 
 
 		 410 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  65.49 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  69.59 
 
 		 395 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  66.92 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  66.5 
 
 		 398 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  65.21 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 399 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  64.69 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  65.66 
 
 		 405 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  63.32 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  64.95 
 
 		 418 aa  522  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  65.8 
 
 		 393 aa  522  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  66.49 
 
 		 394 aa  521  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  64.07 
 
 		 435 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  64.01 
 
 		 404 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  64.41 
 
 		 413 aa  524  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  63.29 
 
 		 422 aa  522  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  65.55 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 		 407 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  62.84 
 
 		 406 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  63.04 
 
 		 422 aa  519  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1531  tryptophan synthase subunit beta  63.61 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.636717  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02381  tryptophan synthase subunit beta  63.86 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  64.95 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  65.74 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01811  tryptophan synthase subunit beta  64.02 
 
 		 416 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0720607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  66.15 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  63.34 
 
 		 425 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  64.02 
 
 		 406 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  65.39 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  65.31 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  62.94 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  65.46 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0055  tryptophan synthase subunit beta  64.03 
 
 		 414 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.660106  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  63.93 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  62.03 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  65.74 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 404 aa  514  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  63.93 
 
 		 409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>