More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0838 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  63.23 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 		 157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  198  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  58.06 
 
 		 155 aa  197  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 		 155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3165  30S ribosomal protein S7  52.9 
 
 		 155 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.987301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  194  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 		 156 aa  193  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  193  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 		 155 aa  192  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 		 156 aa  191  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0474  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  53.55 
 
 		 155 aa  191  4e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0188  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05700  30S ribosomal protein S7  54.43 
 
 		 158 aa  191  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  54.19 
 
 		 155 aa  190  6e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  190  6e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  190  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  190  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  55.48 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1607  ribosomal protein S7  56.13 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.398796 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1144  30S ribosomal protein S7  53.8 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  53.9 
 
 		 156 aa  188  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4340  30S ribosomal protein S7  53.55 
 
 		 155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4448  ribosomal protein S7  54.84 
 
 		 155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0187  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00102254  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0180  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 		 156 aa  187  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0647203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  187  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1538  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1563  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0124145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  57.43 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0596  30S ribosomal protein S7  53.55 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.370718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0710  ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  50.97 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 179 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1855  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 		 155 aa  184  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0321783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0886  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00092509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3717  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  0.0799538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  56.08 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  54.55 
 
 		 156 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>