225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0504 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  40.6 
 
 		 963 aa  782    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 988 aa  2000    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  63.38 
 
 		 480 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  55.27 
 
 		 480 aa  458  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  55.78 
 
 		 480 aa  459  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  55.9 
 
 		 486 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  53.98 
 
 		 480 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  54.76 
 
 		 500 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  55.9 
 
 		 486 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  52.19 
 
 		 480 aa  432  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  51.82 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  55.56 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  54.36 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  54.55 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  52.44 
 
 		 474 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  55.3 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  52.34 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  58.1 
 
 		 488 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  54.78 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  56.82 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  54.01 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  51.93 
 
 		 474 aa  415  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  57.33 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  57.77 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  54.4 
 
 		 484 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  54.78 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  55.06 
 
 		 486 aa  406  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  53.47 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  52.7 
 
 		 477 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  51.41 
 
 		 486 aa  399  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  51.95 
 
 		 482 aa  395  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  52.44 
 
 		 478 aa  396  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  54.03 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  52.34 
 
 		 481 aa  393  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  55.78 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  51.28 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  50.38 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  52.44 
 
 		 477 aa  385  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  49.62 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  53.47 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  51.17 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  48.85 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  50.52 
 
 		 476 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  48.07 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  51.04 
 
 		 476 aa  382  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  49.75 
 
 		 485 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  49.61 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  46.88 
 
 		 477 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  51.82 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  49.36 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  48.48 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  49.74 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  52.17 
 
 		 432 aa  369  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  46.7 
 
 		 486 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  46.45 
 
 		 486 aa  365  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  48.57 
 
 		 486 aa  364  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  49.74 
 
 		 476 aa  363  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  49.74 
 
 		 476 aa  362  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  47.56 
 
 		 443 aa  362  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  52.21 
 
 		 472 aa  361  5e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  52.21 
 
 		 472 aa  360  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  50.52 
 
 		 475 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  49.49 
 
 		 477 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  47.8 
 
 		 488 aa  355  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  46.53 
 
 		 476 aa  353  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  46.79 
 
 		 476 aa  352  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  48.96 
 
 		 476 aa  348  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  50.77 
 
 		 473 aa  347  7e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  50.13 
 
 		 465 aa  342  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  50.26 
 
 		 473 aa  342  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  47.01 
 
 		 488 aa  339  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  51.04 
 
 		 475 aa  318  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  43.89 
 
 		 502 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  45.17 
 
 		 478 aa  304  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  41.82 
 
 		 462 aa  283  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  38.32 
 
 		 447 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  31.19 
 
 		 451 aa  189  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  29.68 
 
 		 661 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  31.15 
 
 		 511 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.12 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  31.55 
 
 		 472 aa  127  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1306  protein of unknown function UPF0027  34.6 
 
 		 439 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560605 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  31.88 
 
 		 396 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  32.78 
 
 		 382 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_003296  RS01749  hypothetical protein  34.98 
 
 		 379 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.447388  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  33.58 
 
 		 389 aa  115  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  27.25 
 
 		 466 aa  114  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  32.43 
 
 		 398 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1492  protein of unknown function UPF0027  32.51 
 
 		 512 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  31.76 
 
 		 398 aa  112  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  27.25 
 
 		 466 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  30.38 
 
 		 463 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  32.99 
 
 		 407 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0205  hypothetical protein  32.76 
 
 		 440 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.044781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  33.33 
 
 		 508 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  33.45 
 
 		 408 aa  109  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  32.23 
 
 		 390 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0344  hypothetical protein  31.66 
 
 		 379 aa  108  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119955  normal  0.8307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  30.07 
 
 		 393 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  31.08 
 
 		 398 aa  108  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>