145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4269 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  87.9 
 
 
372 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  100 
 
 
372 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  66.05 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  62.91 
 
 
372 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  52.63 
 
 
362 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  52.35 
 
 
369 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  51.4 
 
 
365 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  50.14 
 
 
368 aa  348  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.11 
 
 
502 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  38.33 
 
 
500 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  38.83 
 
 
542 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.23 
 
 
543 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  39.62 
 
 
396 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  38.76 
 
 
492 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.64 
 
 
506 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  38.76 
 
 
497 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.32 
 
 
400 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  35.92 
 
 
382 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  33.15 
 
 
397 aa  202  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  34.49 
 
 
387 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  34.06 
 
 
475 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  34.99 
 
 
418 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  40.14 
 
 
514 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  35.59 
 
 
341 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  37.37 
 
 
398 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  33.42 
 
 
383 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  33.8 
 
 
338 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.33 
 
 
404 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  35.6 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  35.01 
 
 
405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  32.77 
 
 
418 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  31.83 
 
 
352 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.69 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  34.46 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.73 
 
 
351 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  34.8 
 
 
407 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  34.18 
 
 
341 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  32.59 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  37.04 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  32.43 
 
 
404 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  35.57 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  31.56 
 
 
405 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  31.75 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  34.46 
 
 
421 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  35.31 
 
 
416 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  30.36 
 
 
375 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  29.04 
 
 
398 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  39.05 
 
 
440 aa  169  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  28.77 
 
 
396 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  34.73 
 
 
413 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  31.51 
 
 
410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  33.54 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  35.59 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  35.11 
 
 
401 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  30.64 
 
 
376 aa  163  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  31.78 
 
 
374 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  36.91 
 
 
405 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  31.23 
 
 
374 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  32.83 
 
 
383 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  31.51 
 
 
410 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  31.51 
 
 
374 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  34.93 
 
 
383 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  34.93 
 
 
392 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  32.03 
 
 
374 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  31.23 
 
 
410 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  34.59 
 
 
392 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  34.56 
 
 
385 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  31.78 
 
 
410 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  31.54 
 
 
386 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  36.43 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  33.22 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  30.96 
 
 
409 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  30.77 
 
 
410 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.49 
 
 
410 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.14 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.14 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.14 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.14 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.14 
 
 
372 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  30.14 
 
 
382 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  30.14 
 
 
433 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  36 
 
 
435 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  32.49 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  32.49 
 
 
380 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  38.01 
 
 
412 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  33.78 
 
 
399 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.56 
 
 
399 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  34.72 
 
 
395 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  32.09 
 
 
422 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  29.74 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  34.38 
 
 
395 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  32.65 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  29.17 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  34.78 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  32.56 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  35.82 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  27.9 
 
 
384 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  29.81 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  29.76 
 
 
431 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  27.98 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>