180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0932 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0932  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  414  1e-115  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544275  normal  0.834774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0819  porin  88.29 
 
 
204 aa  347  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0719605  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  39.05 
 
 
213 aa  127  1e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  36.57 
 
 
213 aa  120  2e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  33.91 
 
 
230 aa  118  8e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  33.91 
 
 
230 aa  118  8e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0692  outer-membrane protein Omp25  38.16 
 
 
201 aa  117  1e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  36.32 
 
 
229 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  37.19 
 
 
207 aa  114  8e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  37.13 
 
 
229 aa  114  1e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  38.24 
 
 
228 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  34.63 
 
 
228 aa  111  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  34.73 
 
 
236 aa  110  1e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  38.54 
 
 
228 aa  110  2e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  33.91 
 
 
244 aa  107  9e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  34.98 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  36.28 
 
 
212 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  37.33 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70273e-05 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  33.33 
 
 
255 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  35.51 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  33.64 
 
 
211 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  1.66827e-05 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  33.02 
 
 
211 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  4.0892e-05 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  37.37 
 
 
250 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  35.42 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  35.15 
 
 
212 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  35.64 
 
 
239 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  34.01 
 
 
234 aa  85.9  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.88 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  30.87 
 
 
283 aa  84.3  1e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.05 
 
 
240 aa  82  5e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.14 
 
 
240 aa  82  6e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.68 
 
 
207 aa  81.6  7e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  29.46 
 
 
240 aa  79.3  3e-14  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  35.5 
 
 
216 aa  78.6  5e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  32.08 
 
 
237 aa  78.6  6e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  33.51 
 
 
206 aa  78.2  8e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  32.5 
 
 
236 aa  77.8  9e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  32.39 
 
 
206 aa  77.8  1e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.7 
 
 
447 aa  76.6  2e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  33.49 
 
 
452 aa  77  2e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  31.82 
 
 
258 aa  76.6  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  32.1 
 
 
225 aa  75.9  4e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.84 
 
 
206 aa  75.1  8e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  31.09 
 
 
207 aa  74.7  9e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.16 
 
 
207 aa  74.7  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  30.04 
 
 
255 aa  73.2  2e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  30.81 
 
 
279 aa  72  5e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  31.67 
 
 
248 aa  72  6e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.15 
 
 
250 aa  71.2  8e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.29 
 
 
661 aa  70.9  1e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  31.9 
 
 
236 aa  71.2  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  33.53 
 
 
662 aa  70.5  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  27.45 
 
 
232 aa  70.5  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  29.44 
 
 
237 aa  70.1  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  30.23 
 
 
212 aa  69.7  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  30.53 
 
 
207 aa  69.3  4e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  28.63 
 
 
708 aa  69.3  4e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.1 
 
 
212 aa  68.9  5e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  28.95 
 
 
261 aa  68.6  6e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  30.62 
 
 
254 aa  68.6  7e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  31.03 
 
 
251 aa  68.2  8e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  33.52 
 
 
241 aa  68.2  9e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  32.8 
 
 
243 aa  67.4  1e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1214  omp25/ropB family outer membrane protein  25.66 
 
 
300 aa  67  2e-10  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.09355e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  32.11 
 
 
246 aa  67  2e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  26.86 
 
 
274 aa  66.2  3e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  32.5 
 
 
247 aa  66.2  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  26.53 
 
 
274 aa  65.9  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1284  hypothetical protein  32.32 
 
 
212 aa  65.5  5e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.40204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.26 
 
 
236 aa  65.5  6e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  26.53 
 
 
274 aa  65.1  6e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  28.91 
 
 
453 aa  65.5  6e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1213  omp25/ropB family outer membrane protein  33.33 
 
 
284 aa  65.1  7e-10  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  7.665e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  33.33 
 
 
689 aa  64.7  8e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  25.42 
 
 
283 aa  65.1  8e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  33.91 
 
 
219 aa  64.7  9e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  29.25 
 
 
251 aa  63.9  1e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  26.67 
 
 
281 aa  64.3  1e-09  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1247  hypothetical protein  31.71 
 
 
212 aa  63.9  1e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  30.19 
 
 
241 aa  64.3  1e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  30.99 
 
 
449 aa  63.9  2e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.85 
 
 
234 aa  63.5  2e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3083  putative outer membrane protein  36.42 
 
 
203 aa  63.5  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.186031 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  27.85 
 
 
230 aa  62.8  3e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.09958e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5381  outer membrane insertion C-terminal signal  25.26 
 
 
299 aa  62.4  4e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0409917  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.53 
 
 
710 aa  62.4  5e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  27.35 
 
 
693 aa  61.6  7e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  30.57 
 
 
240 aa  61.6  8e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1699  hypothetical protein  31.25 
 
 
198 aa  61.2  9e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.013391  normal  0.0555253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  28.51 
 
 
245 aa  61.2  9e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  28.95 
 
 
237 aa  60.8  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  35.06 
 
 
276 aa  60.1  2e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  26.96 
 
 
237 aa  60.1  2e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5303  porin  25.8 
 
 
299 aa  59.7  3e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  34.42 
 
 
279 aa  59.3  4e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  28.14 
 
 
449 aa  59.3  4e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  36.51 
 
 
598 aa  58.9  6e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  29.56 
 
 
692 aa  58.2  8e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2139  hypothetical protein  32.42 
 
 
197 aa  58.2  8e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.811527  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  33.77 
 
 
277 aa  57.4  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>