More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0156 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0156  ABC transporter related  100 
 
 		 517 aa  1049    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000343593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3228  ABC transporter related  79.42 
 
 		 517 aa  844    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0150  ABC transporter related  96.13 
 
 		 517 aa  1016    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995169  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.65 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.7 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.28 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  43.9 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 		 507 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.22 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40.92 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  40.37 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.75 
 
 		 519 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  40.04 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  39.92 
 
 		 537 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.38 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.43 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.24 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39.43 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 		 535 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.45 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.73 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.36 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.25 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  39.87 
 
 		 516 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.4 
 
 		 515 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.29 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  39.8 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 		 516 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  39.92 
 
 		 502 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  38.09 
 
 		 500 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40 
 
 		 520 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  40.82 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  39.33 
 
 		 522 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  39.67 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.55 
 
 		 514 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.48 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  39.75 
 
 		 505 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  39.34 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.51 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  39.07 
 
 		 524 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.48 
 
 		 517 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.21 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.61 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  41.15 
 
 		 508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  40.24 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.45 
 
 		 505 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 516 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  40.08 
 
 		 503 aa  356  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.71 
 
 		 513 aa  356  6.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 516 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 		 510 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.55 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  40.7 
 
 		 502 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  39.55 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.1 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.92 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  37.09 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 522 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 515 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 515 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.41 
 
 		 501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 515 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  39.88 
 
 		 500 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  38.29 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.84 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.4 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.81 
 
 		 514 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  38.26 
 
 		 524 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  38.26 
 
 		 524 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  40.76 
 
 		 507 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  40.12 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  40.28 
 
 		 507 aa  352  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40 
 
 		 501 aa  352  8e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.2 
 
 		 501 aa  352  8e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 501 aa  352  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  38.85 
 
 		 501 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  37.93 
 
 		 500 aa  352  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  39.31 
 
 		 511 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  39.71 
 
 		 501 aa  352  8.999999999999999e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>