More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0139 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  100 
 
 		 308 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  94.16 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  77.92 
 
 		 308 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  73.38 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  62.42 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  62.42 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  62.09 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  60.13 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  58.5 
 
 		 306 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  55.23 
 
 		 306 aa  344  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  58.17 
 
 		 306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  53.92 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  53.25 
 
 		 308 aa  308  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  51.29 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  45.42 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  45.16 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  37.58 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  41.94 
 
 		 322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  39.54 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  37.46 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  42.26 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  36.86 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  44.01 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  40 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  36.89 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  38.87 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  35.69 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  35.26 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  38.06 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  39.34 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  36.77 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  36.45 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  38.83 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  40.27 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  36.91 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  35.58 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  37.26 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  34.6 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  34.74 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  34.31 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  35.35 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  32.17 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  31.83 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  31.17 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  35.74 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 317 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  33.33 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.74 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  34.42 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  32.06 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  34.74 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.97 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32.62 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  31.91 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  31.91 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  31.91 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  31.21 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  32.37 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  34.28 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  30.07 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  33.12 
 
 		 336 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  32.37 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.7 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  33.23 
 
 		 322 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  31.39 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  28.22 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  30.69 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  34.96 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  29.45 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.03 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 		 322 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.93 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.53 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.1 
 
 		 326 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.37 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  31.29 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  32.78 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>