More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0075 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0075  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.716754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0058  methionyl-tRNA formyltransferase  93.57 
 
 		 311 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.820848  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  75.16 
 
 		 311 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  74.28 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  66.56 
 
 		 311 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  65.55 
 
 		 306 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  65.55 
 
 		 306 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  64.03 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  55.7 
 
 		 309 aa  354  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  61.49 
 
 		 307 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  56.59 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  56.45 
 
 		 310 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  56.77 
 
 		 311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  59.09 
 
 		 308 aa  342  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  57.33 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 310 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3065  methionyl-tRNA formyltransferase  57.32 
 
 		 314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0806  methionyl-tRNA formyltransferase  59.21 
 
 		 310 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.283838 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  56.23 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  55.48 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  55.05 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3694  methionyl-tRNA formyltransferase  57.1 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1635  methionyl-tRNA formyltransferase  56.96 
 
 		 309 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  55.99 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  55.52 
 
 		 317 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4568  methionyl-tRNA formyltransferase  54.95 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1917  methionyl-tRNA formyltransferase  55.99 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.741308  normal  0.233989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  53.05 
 
 		 311 aa  311  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  55.92 
 
 		 299 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  53.9 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  54.97 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  51.3 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  51.29 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  51.79 
 
 		 302 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  53.07 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  51.47 
 
 		 302 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  50.8 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  51.91 
 
 		 309 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  51.13 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  48.23 
 
 		 307 aa  271  9e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  46.69 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  49.22 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  47.92 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  48.84 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  48.08 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  48.18 
 
 		 307 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6477  methionyl-tRNA formyltransferase  47.68 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.79537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  47.67 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  43.69 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00190  methionyl-tRNA formyltransferase  49 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.767541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3123  methionyl-tRNA formyltransferase  47.68 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.760657  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0018  methionyl-tRNA formyltransferase  47.6 
 
 		 314 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  46.79 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  42.95 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  45.1 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3181  methionyl-tRNA formyltransferase  47.68 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  45.39 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  46.33 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  46.3 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3064  methionyl-tRNA formyltransferase  47.37 
 
 		 327 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  46.91 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  44.52 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  46.91 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  46.62 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  43.99 
 
 		 320 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3142  methionyl-tRNA formyltransferase  46.63 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.33 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  47.04 
 
 		 327 aa  241  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  44.05 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00160  methionyl-tRNA formyltransferase  48.16 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  44.19 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  46.05 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0086  methionyl-tRNA formyltransferase  46.36 
 
 		 310 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2251  hitchhiker  0.0000000986218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  46.36 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2512  methionyl-tRNA formyltransferase  46.63 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3126  methionyl-tRNA formyltransferase  46.63 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  46.01 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  46.38 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  45.69 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0310  methionyl-tRNA formyltransferase  46.11 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  44.87 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 327 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3407  methionyl-tRNA formyltransferase  45.82 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  45.51 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  42.44 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  45.48 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4415  methionyl-tRNA formyltransferase  46.75 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.628902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0351  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0143  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2275  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2805  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2353  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  42.21 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0160  methionyl-tRNA formyltransferase  46.13 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.701485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2627  methionyl-tRNA formyltransferase  44.73 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.640895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>