272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0055 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  100 
 
 
196 aa  399  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
188 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
186 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  32.02 
 
 
265 aa  108  4e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 
188 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  30 
 
 
182 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
180 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  28.11 
 
 
190 aa  104  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 
183 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
188 aa  99  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
187 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 
184 aa  95.5  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
177 aa  91.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
186 aa  90.5  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
166 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
191 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  32.91 
 
 
194 aa  82.4  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.80603e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
196 aa  80.1  2e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
194 aa  80.1  2e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.72 
 
 
196 aa  80.1  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.72 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.72 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.72 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  32.72 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.72 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  32.72 
 
 
196 aa  79.7  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
196 aa  79  4e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
196 aa  79  4e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
196 aa  78.2  7e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.1 
 
 
196 aa  78.2  7e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
196 aa  78.2  7e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
196 aa  77  2e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
181 aa  77  2e-13  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 
192 aa  76.3  3e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 
181 aa  71.2  8e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
211 aa  71.2  9e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
186 aa  70.9  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
182 aa  70.9  1e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.27 
 
 
178 aa  69.3  3e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
200 aa  68.9  4e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
184 aa  69.3  4e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
203 aa  68.9  4e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  27.04 
 
 
205 aa  68.9  5e-11  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 
182 aa  68.9  5e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
194 aa  68.9  5e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  29.61 
 
 
182 aa  68.2  7e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  26.44 
 
 
177 aa  68.2  7e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 
184 aa  68.2  7e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
204 aa  67.8  9e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 
203 aa  67.4  1e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
179 aa  67  1e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
204 aa  67.8  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  24.16 
 
 
177 aa  66.6  2e-10  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  26.4 
 
 
179 aa  65.9  3e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  66.2  3e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77311e-14 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  27.47 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0227  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
185 aa  65.9  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.282406  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
177 aa  65.5  4e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  25.84 
 
 
179 aa  65.9  4e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
204 aa  65.5  5e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  25.42 
 
 
179 aa  65.1  6e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 
182 aa  65.5  6e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
208 aa  65.1  7e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
180 aa  64.7  8e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 
183 aa  64.7  9e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.9196e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  24.85 
 
 
186 aa  64.7  9e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  30 
 
 
184 aa  63.9  1e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
179 aa  64.3  1e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
171 aa  63.9  1e-09  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  25.84 
 
 
179 aa  63.9  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
215 aa  62.8  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 
199 aa  62.8  3e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 
184 aa  62.4  4e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
199 aa  62  5e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  26.9 
 
 
185 aa  62  5e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3598  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
193 aa  62  5e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
180 aa  62  6e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
180 aa  61.6  7e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
179 aa  60.8  1e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  6.19655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  24.72 
 
 
181 aa  60.8  1e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
178 aa  60.1  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
199 aa  60.1  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
191 aa  59.7  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
184 aa  58.9  5e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
180 aa  58.2  8e-08  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
228 aa  58.2  8e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 
183 aa  58.2  8e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  27.15 
 
 
187 aa  57.8  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
186 aa  57.4  1e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 
201 aa  57.4  1e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>