More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0008 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  95.71 
 
 
210 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  76.59 
 
 
208 aa  308  3e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  74.24 
 
 
204 aa  289  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  73.72 
 
 
228 aa  245  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  73.72 
 
 
230 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  73.08 
 
 
230 aa  244  7e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  67.05 
 
 
222 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  65.91 
 
 
222 aa  235  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  60 
 
 
206 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  67.72 
 
 
204 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  65.43 
 
 
206 aa  221  5e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  60.77 
 
 
226 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  63.19 
 
 
207 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  56.02 
 
 
205 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  60.48 
 
 
202 aa  213  1e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.47 
 
 
202 aa  212  3e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.9 
 
 
207 aa  211  8e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.09 
 
 
217 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  62.91 
 
 
202 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  54.4 
 
 
203 aa  208  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  66 
 
 
206 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  53.3 
 
 
197 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  60.9 
 
 
187 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  51.72 
 
 
201 aa  199  2e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  55.33 
 
 
213 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  46.53 
 
 
210 aa  147  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  49.66 
 
 
181 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  48.43 
 
 
186 aa  140  1e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  48.43 
 
 
186 aa  140  1e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  46.45 
 
 
205 aa  140  1e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  48.43 
 
 
189 aa  140  1e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  48.32 
 
 
210 aa  139  2e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  47.06 
 
 
197 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  43.5 
 
 
188 aa  134  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  49.62 
 
 
181 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  43.14 
 
 
221 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  41.82 
 
 
187 aa  131  7e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  40.51 
 
 
202 aa  130  1e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  44.44 
 
 
189 aa  129  2e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  42.11 
 
 
210 aa  130  2e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  41.46 
 
 
188 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  43.51 
 
 
157 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  38.59 
 
 
206 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  43.95 
 
 
240 aa  129  4e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  44.16 
 
 
186 aa  128  5e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.54 
 
 
206 aa  129  5e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.75754e-08  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  8.27789e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  7.67299e-10  decreased coverage  7.11999e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  7.98826e-07  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.63417e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 
201 aa  128  7e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.57049e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 
206 aa  127  1e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.25429e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  38.59 
 
 
203 aa  126  2e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.69534e-09  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.59 
 
 
203 aa  125  4e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.98857e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  44.08 
 
 
179 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  35.27 
 
 
209 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  38.74 
 
 
194 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.6941e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40.59 
 
 
181 aa  120  1e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  41.38 
 
 
200 aa  120  2e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.5112e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  38.95 
 
 
245 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  41.44 
 
 
189 aa  119  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 
201 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.03997e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  39.6 
 
 
208 aa  118  5e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  41.84 
 
 
212 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 
195 aa  118  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 
200 aa  118  8e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.63848e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  41.45 
 
 
187 aa  118  8e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 
179 aa  116  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.5 
 
 
190 aa  116  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  41.89 
 
 
194 aa  117  2e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 
195 aa  116  2e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  34.12 
 
 
209 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 
213 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  36.97 
 
 
193 aa  115  4e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  39.31 
 
 
205 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  9.76111e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  39.89 
 
 
193 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40.56 
 
 
198 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  39.13 
 
 
200 aa  114  1e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  44.06 
 
 
185 aa  114  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 
181 aa  113  2e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  42.25 
 
 
181 aa  113  2e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 
181 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  42.36 
 
 
198 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  37.89 
 
 
183 aa  112  4e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  41.82 
 
 
184 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  38.73 
 
 
204 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  37.99 
 
 
186 aa  112  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.15 
 
 
210 aa  111  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  43.06 
 
 
178 aa  111  7e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 
209 aa  111  7e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  4.35816e-05  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1527  heat shock protein GrpE  44.08 
 
 
189 aa  111  8e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  39.02 
 
 
282 aa  111  8e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  42.95 
 
 
194 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>