43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6184 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  100 
 
 		 284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  60.98 
 
 		 1697 aa  336  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  58.72 
 
 		 1703 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  59.79 
 
 		 1748 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  58.01 
 
 		 1700 aa  315  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  57.09 
 
 		 1697 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  60.07 
 
 		 1702 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  60.53 
 
 		 1701 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  58.33 
 
 		 1417 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  55.16 
 
 		 470 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  47.25 
 
 		 1693 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  55.56 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  67.71 
 
 		 1516 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  34.29 
 
 		 2077 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  33.5 
 
 		 2274 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  47.97 
 
 		 1722 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 1674 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  35.16 
 
 		 1642 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  31.88 
 
 		 1726 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  37.11 
 
 		 2570 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  35.16 
 
 		 1669 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  38.42 
 
 		 1956 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  43.1 
 
 		 1606 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  34.48 
 
 		 2098 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1925 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  31.32 
 
 		 1669 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  31.34 
 
 		 1706 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  30.69 
 
 		 1932 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  46.08 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  46.67 
 
 		 1575 aa  80.1  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  39.84 
 
 		 2005 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  29.1 
 
 		 1649 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  29.63 
 
 		 1934 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 1594 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  33.09 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  36.52 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  25.45 
 
 		 2117 aa  50.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  36.67 
 
 		 527 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  29.79 
 
 		 527 aa  45.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.94 
 
 		 489 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  37.63 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.88 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  21.54 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>