More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3329 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 399 aa  825    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  68.16 
 
 		 413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  61.92 
 
 		 419 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  59.22 
 
 		 431 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  61 
 
 		 409 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  61.32 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  60.86 
 
 		 404 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  57.11 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  55.98 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  52.5 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  53.52 
 
 		 427 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  53.65 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  52.69 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  51.92 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  51.41 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  49.75 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  50.25 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  50.25 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  61.49 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  42.67 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  43.15 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 		 413 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 424 aa  269  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 402 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 439 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.51 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  32.15 
 
 		 404 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  34.74 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  35.8 
 
 		 398 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  32.85 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  35.31 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  33.24 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  32.09 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  32.34 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  32.55 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.92 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  32.25 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  37.12 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  37.68 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  32.7 
 
 		 304 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  32.36 
 
 		 396 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  32.57 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  30.54 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  32.36 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  33.11 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30.71 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  34.57 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  34.05 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1227  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  30.65 
 
 		 395 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2124  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0688  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.96208  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  30.68 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 		 362 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 364 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>