More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2698 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  57.48 
 
 		 576 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 603 aa  1244    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  71.94 
 
 		 571 aa  842    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  59.44 
 
 		 595 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  42.81 
 
 		 539 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  41.69 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  41.53 
 
 		 555 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  42.26 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  42.09 
 
 		 541 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  42.26 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  42.61 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  42.26 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  42.26 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 539 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  41.91 
 
 		 539 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 539 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  42.13 
 
 		 556 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  42.91 
 
 		 557 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  41.81 
 
 		 576 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  39.93 
 
 		 551 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  41.39 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 		 535 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  40.51 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  41.45 
 
 		 538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 		 543 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 543 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 532 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 513 aa  362  9e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 539 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 562 aa  323  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  38.66 
 
 		 526 aa  320  7e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 541 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 530 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  33.45 
 
 		 528 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 548 aa  296  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.27 
 
 		 528 aa  296  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 528 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  32.91 
 
 		 522 aa  295  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  33.09 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  32.78 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 537 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 528 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 522 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 530 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  32.91 
 
 		 528 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  32.91 
 
 		 528 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 539 aa  288  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 539 aa  288  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  31.89 
 
 		 531 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 522 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 547 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 557 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 554 aa  270  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  32.57 
 
 		 556 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  35.85 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 572 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 568 aa  267  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 568 aa  267  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 557 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6230  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 555 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  34.38 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 585 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  32.92 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  30.74 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  30.87 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 555 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 572 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 571 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 555 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 555 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605895  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 555 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  30.64 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>