71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1714 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  100 
 
 
383 aa  761    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  51.48 
 
 
382 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  29.92 
 
 
371 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  31.73 
 
 
362 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  32.13 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  31.88 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  31.17 
 
 
357 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  27.45 
 
 
364 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  29.84 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  27.72 
 
 
361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  27.12 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.4 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  28.42 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.95 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  28.16 
 
 
373 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  28.16 
 
 
373 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.94 
 
 
373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  29.1 
 
 
373 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  29.1 
 
 
373 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  29.1 
 
 
373 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  29.1 
 
 
373 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  29.1 
 
 
373 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  29.1 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  29.1 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.16 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.68 
 
 
373 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  27.68 
 
 
373 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  28.16 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  30.53 
 
 
337 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.33 
 
 
439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.76 
 
 
439 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.79 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  27.47 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  36.05 
 
 
363 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  22.87 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  23.05 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  28.45 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  27.01 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.39 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  34.29 
 
 
372 aa  67  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.8 
 
 
363 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.36 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  25.92 
 
 
340 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  31.78 
 
 
461 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  22.87 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.58 
 
 
343 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  26.11 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  34.78 
 
 
344 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  32.79 
 
 
354 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  32.81 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05856  hypothetical protein  26.27 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  28.15 
 
 
520 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  26.27 
 
 
437 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  26.77 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  27.43 
 
 
508 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  25.74 
 
 
533 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  28.7 
 
 
790 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  26.5 
 
 
371 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  30 
 
 
342 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  30.52 
 
 
441 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  27.59 
 
 
365 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2997  ImpA domain-containing protein  36.25 
 
 
455 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  29.77 
 
 
789 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2485  ImpA domain-containing protein  35 
 
 
455 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  25 
 
 
518 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>