More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0040 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0040  CBS  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  82.88 
 
 		 146 aa  257  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  63.19 
 
 		 144 aa  197  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  61.54 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  60.84 
 
 		 153 aa  180  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  59.72 
 
 		 146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  59.44 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  59.44 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  58.74 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  57.64 
 
 		 147 aa  176  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  58.04 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  58.04 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  56.94 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  58.74 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  57.34 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  58.04 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  57.34 
 
 		 146 aa  170  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  52.78 
 
 		 164 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  51.03 
 
 		 163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  54.73 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  55.71 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  55.24 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  53.85 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  53.15 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  53.52 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  51.75 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  51.39 
 
 		 143 aa  151  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  52.45 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  52.45 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  50.69 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  53.73 
 
 		 140 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  51.39 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  51.39 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  49.31 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  46.48 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  48.61 
 
 		 145 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  51.05 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  51.72 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  49.65 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  51.03 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  48.2 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  53.85 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  53.1 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  49.28 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  46.81 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  45.52 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  44.6 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  44.06 
 
 		 148 aa  120  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  42.64 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  51.49 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  39.53 
 
 		 177 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  37.4 
 
 		 182 aa  91.3  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  35.97 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  37.29 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  36.92 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  39.23 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.93 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  35 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  37.98 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  35 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  40.44 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  39.45 
 
 		 688 aa  87  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  39.45 
 
 		 688 aa  87  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.61 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  36.69 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  42.4 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  39.13 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  34.53 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3004  signal-transduction protein  35.88 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.92 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  35.46 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  38.1 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3204  putative signal transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3103  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.11 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  38.03 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.92 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1594  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0792656  normal  0.0914087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  32.56 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  40.18 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.62 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  31.5 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  36.09 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  40.46 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>