270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0844 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  76.59 
 
 		 447 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  898    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  76.91 
 
 		 471 aa  690    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  65.4 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  74.44 
 
 		 222 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  33.77 
 
 		 459 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  33.12 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.3 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  53.89 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.67 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  28.61 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  53.59 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  51.67 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  51.67 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  51.67 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  51.67 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  51.67 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.89 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.59 
 
 		 421 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.26 
 
 		 412 aa  163  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  50 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  50 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  29.5 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  50.53 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.43 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.58 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  46.74 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  32.07 
 
 		 470 aa  156  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  28.67 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  26.77 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  45.51 
 
 		 684 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  37.22 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  59.05 
 
 		 183 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  60.38 
 
 		 196 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  35 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  38.55 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.53 
 
 		 488 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  52.38 
 
 		 203 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  48.74 
 
 		 169 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  53.47 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  51.4 
 
 		 200 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  34.08 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.61 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.47 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.01 
 
 		 274 aa  98.2  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  62.67 
 
 		 177 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.96 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  46.49 
 
 		 212 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.09 
 
 		 597 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  41.94 
 
 		 184 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.92 
 
 		 293 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  42.2 
 
 		 178 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.03 
 
 		 293 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.48 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  43.97 
 
 		 459 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.64 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.46 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  41 
 
 		 196 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.24 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.62 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  25 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  52.63 
 
 		 87 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.88 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.88 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  24.63 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.66 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  34.62 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.06 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.56 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  57.14 
 
 		 131 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.97 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.77 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.08 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.37 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  56.25 
 
 		 77 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  27.37 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.62 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.88 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.11 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.08 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.99 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.26 
 
 		 849 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4984  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.13 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677083  normal  0.015231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.23 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.62 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.33 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.85 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.36 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.59 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.25 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.63 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.14 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.39 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.25 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.75 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>