127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2183 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
348 aa  728    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.303521  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1293  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  80.82 
 
 
356 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.93085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1128  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.71 
 
 
251 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.21 
 
 
370 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  28.39 
 
 
441 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  37.21 
 
 
294 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.21 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  37.21 
 
 
294 aa  56.2  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  36.08 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  36.05 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  33.65 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  35.87 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.22 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.3 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.53 
 
 
379 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  34.94 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.94 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.15 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.14 
 
 
372 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.09 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  35.29 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  35.29 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  35.29 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  35.29 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  35.29 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  31.4 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  33.04 
 
 
377 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  31.4 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.58 
 
 
398 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.95 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.82 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.19 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  29.51 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  33.33 
 
 
283 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.39 
 
 
419 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.09 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  32.58 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.77 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.52 
 
 
369 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.09 
 
 
375 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0550  site-specific DNA-methyltransferase, putative  34.29 
 
 
250 aa  49.7  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.20676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.27 
 
 
323 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0197  hypothetical protein  27.87 
 
 
646 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  31.25 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  32.14 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.24 
 
 
425 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.52 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.91 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  31.31 
 
 
380 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  34.31 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  30.85 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.08 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52350  adenine specific DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
560 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  39.68 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  33.33 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.33 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.46 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  37.5 
 
 
411 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.12 
 
 
394 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.92 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.48 
 
 
368 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  30.36 
 
 
372 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.88 
 
 
259 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.29 
 
 
545 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  32.86 
 
 
251 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  30.36 
 
 
376 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  26.6 
 
 
266 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  30.36 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.53 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  31.43 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0019  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.23 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.846659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.14 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.14 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.38 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.75 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3656  adenine specific DNA methylase Mod  31.75 
 
 
567 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000129355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  26.14 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  33.33 
 
 
684 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0037  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.33 
 
 
325 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000954073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.2 
 
 
471 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  27.05 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  27.05 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.93 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.69 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.93 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  21.96 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.68 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  30.89 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  30.89 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.69 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>