225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05397 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  66.4 
 
 		 254 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  64.71 
 
 		 256 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  54.98 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  51.82 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  55.6 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  54.77 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2592  LamB/YcsF family protein  50.79 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  51.6 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  48.41 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  48.61 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  50.19 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  46.83 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  46.51 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  46.48 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5650  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  48.18 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  45.45 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  45.74 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  44.05 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  51.19 
 
 		 304 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  46.28 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  49.79 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1829  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1341  LamB/YcsF family protein  43.92 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  41.67 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.52 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  42.46 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 260 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  44.21 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.39 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  45.27 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  43.65 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  45.35 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.98 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 258 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  46.28 
 
 		 273 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40.93 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  46.09 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  46.26 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  46.91 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  39.44 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 250 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  43.08 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  43.82 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  40.98 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  45.42 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  44.26 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01080  LamB/YcsF family protein  41.39 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  42.91 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  40.64 
 
 		 255 aa  192  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  44.81 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  43.98 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  38.87 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.72 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  40.83 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.49 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  37.76 
 
 		 246 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  42.56 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  43.44 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>