82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1969 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 235 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  81.78 
 
 		 240 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  78.42 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  76.08 
 
 		 220 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  68.87 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  70.05 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  55 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  55 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  57.14 
 
 		 159 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  54.41 
 
 		 222 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  54.41 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  52.14 
 
 		 177 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  52.14 
 
 		 177 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  59.85 
 
 		 156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  59.85 
 
 		 156 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  59.09 
 
 		 157 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  50.36 
 
 		 183 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  47.77 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  53.79 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  58.02 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  55.3 
 
 		 144 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  44.72 
 
 		 176 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  53.9 
 
 		 185 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  48.97 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  48.97 
 
 		 187 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  38.19 
 
 		 177 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  45.77 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  38.89 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  38.1 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  39.89 
 
 		 371 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  49.31 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  43.06 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  47.79 
 
 		 139 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  45.59 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  42.95 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  47.18 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  42.28 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  39.29 
 
 		 172 aa  102  7e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  41.26 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.85 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  40.41 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  36.62 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000525183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  35.81 
 
 		 183 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  41.3 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  38.51 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  35.46 
 
 		 165 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  38.41 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  37.09 
 
 		 165 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  36.71 
 
 		 171 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  38.93 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  38.22 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  42.11 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  31.58 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  35.33 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  41.91 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  33.57 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  32.08 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  32.59 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  32.59 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  34.19 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  29.79 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  32.08 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  27.62 
 
 		 506 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  30.92 
 
 		 526 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  30.92 
 
 		 526 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  30.92 
 
 		 526 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  30.77 
 
 		 169 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  30.88 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  26.75 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  30.88 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  29.71 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  35.09 
 
 		 646 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5838  hypothetical protein  27.81 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  33.33 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  27.08 
 
 		 190 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2958  phage prohead protease, HK97 family  29.17 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  29.32 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  29.32 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  29.32 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  29.32 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  36.36 
 
 		 420 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  24.86 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>