More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0844 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  92.76 
 
 		 290 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  90.34 
 
 		 290 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  85.12 
 
 		 291 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  82.7 
 
 		 289 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  82.7 
 
 		 289 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  80 
 
 		 290 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  64.46 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  62.46 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  62.94 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  63.29 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  62.94 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  65.27 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  55.52 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 		 289 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  61.62 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  59.11 
 
 		 290 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  57.99 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  57.5 
 
 		 291 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  57.54 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  61.97 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  57.62 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  56.38 
 
 		 286 aa  295  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  55.52 
 
 		 284 aa  294  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  58.15 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  57.99 
 
 		 288 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  56.6 
 
 		 289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  58.28 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  58.28 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  57.59 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  53.19 
 
 		 284 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  53.74 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  59.17 
 
 		 290 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  57.35 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  52.98 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  52.03 
 
 		 299 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  58.74 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  51.25 
 
 		 288 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  52.01 
 
 		 287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  47.29 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  45.04 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  55.33 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.43 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.59 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.62 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 280 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.71 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.8 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.4 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  26.12 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.14 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  34.42 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  34.42 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  26.98 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.14 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  26.5 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  26.62 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.9 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.9 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  27.64 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.73 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  32.95 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.73 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  31.52 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  29.71 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.44 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  26.74 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  26.74 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  30.11 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  26.74 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.18 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  24.73 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.94 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  28.88 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  27.24 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  27.54 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  31.27 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  25.85 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.92 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  28.31 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  28.83 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  27.8 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  29.21 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  29.59 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  32.3 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.81 
 
 		 351 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  27.24 
 
 		 415 aa  99  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>