More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3849 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  78.02 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  54.55 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0563  cytochrome c oxidase subunit II  52.68 
 
 		 394 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  48.76 
 
 		 336 aa  198  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3098  QoxB, quinol oxidase subunit II  53.69 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3668  cytochrome-c oxidase  55.78 
 
 		 378 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.253259  normal  0.882679 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  43.95 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3825  cytochrome c oxidase, subunit II  50.53 
 
 		 189 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  39.82 
 
 		 352 aa  161  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  39.91 
 
 		 326 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  48.06 
 
 		 315 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  42.03 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  38.64 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  39.7 
 
 		 345 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  37.26 
 
 		 334 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  41.59 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  40.72 
 
 		 354 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  40.21 
 
 		 434 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  38.38 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  39.23 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  37.2 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0118  cytochrome c oxidase, subunit IIC  38.14 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134505  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  33.49 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  38.97 
 
 		 352 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  37.88 
 
 		 372 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1754  cytochrome c, monohaem  39.9 
 
 		 324 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  37.81 
 
 		 381 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  39.9 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  38.32 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  39.39 
 
 		 353 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  40.41 
 
 		 370 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  37.85 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  40.09 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  41.2 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 		 367 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.75 
 
 		 370 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  34.29 
 
 		 354 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  37.39 
 
 		 338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  38.54 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  34.68 
 
 		 425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  32.68 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  46.28 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 		 334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.43 
 
 		 355 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  31.73 
 
 		 260 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  40.13 
 
 		 318 aa  111  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  31.65 
 
 		 290 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  29.75 
 
 		 349 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 289 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5009  ubiquinol oxidase, subunit II  33.47 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.348819  normal  0.0229485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3968  ubiquinol oxidase, subunit II  33.2 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  36.75 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 287 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  41.6 
 
 		 435 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 290 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  33.17 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  30.51 
 
 		 269 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  29.86 
 
 		 399 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  42.06 
 
 		 316 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1209  ubiquinol oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 295 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0864701  normal  0.353676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.57 
 
 		 272 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  36.17 
 
 		 336 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1637  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  33.95 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140878  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  31.43 
 
 		 343 aa  98.2  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 279 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.55 
 
 		 316 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  38.66 
 
 		 313 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0954  ubiquinol oxidase, subunit II  27.64 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 279 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0772  quinol oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0669  quinol oxidase subunit II  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0613  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0614  quinol oxidase, subunit 2 (cytochrome c oxidase, subunit II)  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0830  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0758  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000573305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  27 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5376  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II  32.16 
 
 		 283 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0703  quinol oxidase subunit II  30.4 
 
 		 291 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  36.97 
 
 		 349 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  27.63 
 
 		 314 aa  96.3  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  26.67 
 
 		 359 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6006  ubiquinol oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  39.68 
 
 		 318 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2071  ubiquinol oxidase, subunit II  31.43 
 
 		 295 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.741779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0737  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0350513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 		 337 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0591  quinol oxidase AA3, subunit II  27.75 
 
 		 291 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 337 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  38.94 
 
 		 315 aa  95.5  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>